RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 MORN5Q5VZ52 161 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 LEMD1Q68G75 181 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 LCN15Q6UWW0 184 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 OR8I2Q8N0Y5 310 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 SFT2D1Q8WV19 159 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 SLC25A2Q9BXI2 301 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 ATRQ13535 2644 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 CHEK1O14757 476 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 CD5P06127 495 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 CBLN1P23435 193 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 GALR1P47211 349 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 CLLU1Q5K131 121 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 C16orf54Q6UWD8 224 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 SSX7Q7RTT5 188 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 PAXXQ9BUH6 204 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 OR51M1Q9H341 326 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 TMEM14CQ9P0S9 112 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa9.1□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa9.1□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 TRAV5A0A0B4J249 113 aa9.1□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa9.1□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 HELTA6NFD8 242 aa9.1□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 APOHP02749 345 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 NMBP08949 121 aa9.1□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 FOLR2P14207 255 aa9.1□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 IL34Q6ZMJ4 242 aa9.1□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 IQCF2Q8IXL9 164 aa9.1□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 DYNLRB2Q8TF09 96 aa9.1□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 GLMPQ8WWB7 406 aa9.1□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.1□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.1□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP9.09□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 CSN3P07498 182 aa9.09□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 GP9P14770 177 aa9.09□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 GCHFRP30047 84 aa9.09□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 PSMB3P49720 205 aa9.09□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 MEOX2P50222 304 aa9.09□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 PPT1P50897 306 aa9.09□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa9.09□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 LYPD6BQ8NI32 183 aa9.09□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 HRH4Q9H3N8 390 aa9.09□□□□□ -0.95
LMO3-218ENST00000538020 A0A1B0GV50 99 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 IFNA1P01562 189 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 PYYP10082 97 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 GUK1Q16774 197 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 ZNF503Q96F45 646 aa9.08□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 A0A087X0K7 114 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 ZNF785A8K8V0 405 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 SAP30O75446 220 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 OR10J4P0C629 311 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 NBEAP1P0C6P0 100 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 CD33P20138 364 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 EDN2P20800 178 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 TCF24Q7RTU0 167 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 FXYD5Q96DB9 178 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 MDFIQ99750 246 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 MANBALQ9NQG1 85 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 MLXQ9UH92 298 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 IGLC2P0DOY2 106 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 RPL11P62913 178 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 PMS2P11Q13670 270 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 PDE6HQ13956 83 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 SUN5Q8TC36 379 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 GNG13Q9P2W3 67 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 TRBV19A0A075B6N1 114 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 ZNF253O75346 499 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 INSL3P51460 131 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 PAFAH1B2P68402 229 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 DEFB114Q30KQ6 69 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 C9orf66Q5T8R8 295 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 FAM90A2PQ658T7 463 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 OR2K2Q8NGT1 345 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 BLNKQ8WV28 456 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 NRN1Q9NPD7 142 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 ZNF586Q9NXT0 402 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-218ENST00000538020 A0A1W2PRE2 83 aa9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms