RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.65□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 C3orf36Q3SXR2 165 aa8.65□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 LINC00696Q6ZRV3 163 aa8.65□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 Q6ZS92 163 aa8.65□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.65□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 SGK494Q96LW2 274 aa8.65□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.65□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 SCNM1Q9BWG6 230 aa8.65□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 DEFB127Q9H1M4 99 aa8.65□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 VCX2Q9H322 139 aa8.65□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.65□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 NCOR1O75376 2440 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 PPIAL4EA0A075B759 164 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 A0A096LNJ9 63 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 A0A1W2PRD5 423 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 A0A1W2PRF3 423 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 A0A1W2PRM7 423 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 D6R8Y8 96 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 AGFG2O95081 481 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 IGLV2-11P01706 119 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 PPIAL4FP0DN26 164 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 FZR1Q9UM11 496 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 COL6A3P12111 3177 aa8.64□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 LAMA1P25391 3075 aa8.63□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa8.63□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 LINC01546A6NGU7 62 aa8.63□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 E9PLD3 99 aa8.63□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 EVI2AP22794 236 aa8.63□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 CCL11P51671 97 aa8.63□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 CKS1BP61024 79 aa8.63□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.63□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.63□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 CEND1Q8N111 149 aa8.63□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 LINC00311Q8N616 119 aa8.63□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 RND1Q92730 232 aa8.63□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 GAFA1Q96PS6 74 aa8.63□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 PSG8Q9UQ74 426 aa8.63□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 LINC01619G3V211 115 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 K7EM74 188 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 NDUFS7O75251 213 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 TWIST1Q15672 202 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 ZMAT4Q9H898 229 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 USP34Q70CQ2 3546 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 BDP1A6H8Y1 2624 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 OVOL3O00110 214 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 SLC25A17O43808 307 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 DPM2O94777 84 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 CKS2P33552 79 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 GLRXP35754 106 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 PAX8Q06710 450 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 ZNF479Q96JC4 524 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 SPRY4Q9C004 299 aa8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 PCSK5Q92824 1860 aa8.61□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 TANC2Q9HCD6 1990 aa8.61□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.61□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.61□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 CGB1A6NKQ9 187 aa8.61□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 IGKCP01834 107 aa8.61□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 IGHG3P01860 377 aa8.61□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 TNFRSF1AP19438 455 aa8.61□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 FCER1GP30273 86 aa8.61□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 RAB9AP51151 201 aa8.61□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 PDE6HQ13956 83 aa8.61□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 GAGE13Q4V321 117 aa8.61□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.61□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 PCP2Q8IVA1 136 aa8.61□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 TTC9CQ8N5M4 171 aa8.61□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 ARPC1AQ92747 370 aa8.61□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 NGBQ9NPG2 151 aa8.61□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 DYSFO75923 2080 aa8.61□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 DOCK10Q96BY6 2186 aa8.6□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 A0A1W2PPI3 338 aa8.6□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 PRR33A8MZF0 331 aa8.6□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 IGLL5B9A064 214 aa8.6□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 NKX2-8O15522 239 aa8.6□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 CD59P13987 128 aa8.6□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 FXYD2P54710 66 aa8.6□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 FOXE3Q13461 319 aa8.6□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.6□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 TEX36Q5VZQ5 186 aa8.6□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.6□□□□□ -1.03
LMO3-215ENST00000537304 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms