RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 BTF3L4Q96K17 158 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC00479Q96M42 142 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 MOB4Q9Y3A3 225 aa8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PPQ1 181 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 ISLRO14498 428 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 IL4P05112 153 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 S100A9P06702 114 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 IGLC2P0DOY2 106 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 GATA3P23771 443 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 ADMP35318 185 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 CNN1P51911 297 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 RPL15P61313 204 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 GNG5P63218 68 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 Q56UQ5 140 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 BRD3OSQ6XYD6 125 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 PRIMA1Q86XR5 153 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 BLNKQ8WV28 456 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 Q9H3A6 140 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 OTORQ9NRC9 128 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 WNK2Q9Y3S1 2297 aa8.4□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.4□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.4□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF98A6NK75 572 aa8.4□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 INAFM1C9JVW0 142 aa8.4□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 PPP5D1E7EU14 171 aa8.4□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 G3V318 75 aa8.4□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC17A3O00476 420 aa8.4□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 BRI3O95415 125 aa8.4□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 NDUFA6P56556 154 aa8.4□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 ECSCRQ19T08 205 aa8.4□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.4□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.4□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC01356Q8N9X3 169 aa8.4□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 MDFIQ99750 246 aa8.4□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.4□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 HIF1ANQ9NWT6 349 aa8.4□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF24Q9Y225 148 aa8.4□□□□□ -1.06
SH3BP2-209ENST00000504450 ACANP16112 2415 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF320A2RRD8 509 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 H3BTX0 84 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV3-23P01764 117 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 TCRAP04437 139 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 ERVFC1-1P60608 527 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 RHOGP84095 191 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 S100A7AQ86SG5 101 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM219Q86XT9 240 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 BAGE2Q86Y30 109 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 SMIM12Q96EX1 92 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP6V0BQ99437 205 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 ATG101Q9BSB4 218 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 MLST8Q9BVC4 326 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 ABCA1O95477 2261 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 IFITM10A6NMD0 228 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 J3QLI3 93 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 IGF1P05019 195 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 AKR1D1P51857 326 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 C15orf32Q32M92 178 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 C17orf77Q96MU5 243 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR82Q96P67 336 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAV41A0A0B4J266 112 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2T8A6NH00 312 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 H3BUX3 64 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 SCGB2A1O75556 95 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 LTAP01374 205 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 IGLV2-11P01706 119 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHG2P01859 326 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 S100A8P05109 93 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 RPEL1Q2QD12 228 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 FMC1Q96HJ9 113 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC140Q96MF4 163 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 DNHD1Q96M86 4753 aa8.37□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 M0QZK8 103 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 FSHBP01225 129 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 CLEC3BP05452 202 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
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