RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495555.6

IFT27-211, Transcript of intraflagellar transport 27, humanhuman

TSL 2

Gene IFT27, Length 744 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27-211ENST00000495555 GGACTQ9BVM4 153 aa8.75□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 C20orf85Q9H1P6 137 aa8.75□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 DOK5Q9P104 306 aa8.75□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.74□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 A0A0J9YX75 114 aa8.74□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.74□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.74□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 GOSR2O14653 212 aa8.74□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 PLA2G10O15496 165 aa8.74□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 TCRBP04435 133 aa8.74□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 LINC00869P0C866 280 aa8.74□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.74□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 FXYD7P58549 80 aa8.74□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 DEFB1P60022 68 aa8.74□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 PLP1P60201 277 aa8.74□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 FGL1Q08830 312 aa8.74□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.74□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 Q6ZTC4 211 aa8.74□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.74□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.74□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 CCDC32Q9BV29 185 aa8.74□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 RFNGQ9Y644 331 aa8.74□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.73□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 TRAV6A0A075B6T7 132 aa8.73□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.73□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 C5orf51A6NDU8 294 aa8.73□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 FAM25EA8MYX2 175 aa8.73□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 H3BRN7 92 aa8.73□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 K7EPK0 472 aa8.73□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 DEDDO75618 318 aa8.73□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 AMBPP02760 352 aa8.73□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 EMP1P54849 157 aa8.73□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 RAB31Q13636 194 aa8.73□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 C12orf74Q32Q52 190 aa8.73□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.73□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.73□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 RNF126Q9BV68 326 aa8.73□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.73□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 ARL6Q9H0F7 186 aa8.73□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 APLNQ9ULZ1 77 aa8.73□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.72□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 C7orf66A4D0T2 115 aa8.72□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 F6UB75 175 aa8.72□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 HBE1P02100 147 aa8.72□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 MBPP02686 304 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.72□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 BCAP31P51572 246 aa8.72□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 MZT2BQ6NZ67 158 aa8.72□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 LINC00299Q6ZSB3 139 aa8.72□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 ZNF546Q86UE3 836 aa8.72□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 ZNF709Q8N972 641 aa8.72□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 C20orf173Q96LM9 149 aa8.72□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.72□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 NUDT15Q9NV35 164 aa8.72□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
IFT27-211ENST00000495555 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa8.71□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 CCNKO75909 580 aa8.71□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 B2MP61769 119 aa8.71□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 RRN3P1Q2M238 152 aa8.71□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 ZNF738Q8NE65 137 aa8.71□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 S100ZQ8WXG8 99 aa8.71□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.71□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 ARV1Q9H2C2 271 aa8.71□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.71□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 CELA1Q9UNI1 258 aa8.71□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.7□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 CCSO14618 274 aa8.7□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 AGPAT2O15120 278 aa8.7□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 CAV2P51636 162 aa8.7□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 CNN1P51911 297 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 SLC38A11Q08AI6 406 aa8.7□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 GSG1LQ6UXU4 331 aa8.7□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 Q6ZRG5 221 aa8.7□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 ZNF767PQ75MW2 155 aa8.7□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 C2orf50Q96LR7 162 aa8.7□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 UHRF2Q96PU4 802 aa8.7□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 NDUFAF3Q9BU61 184 aa8.7□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 A0A087X0K7 114 aa8.69□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.69□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 A8MTW9 85 aa8.69□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 COX7A2P2O60397 106 aa8.69□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 INSP01308 110 aa8.69□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 RHOBP62745 196 aa8.69□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 PSG3Q16557 428 aa8.69□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.69□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.69□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.69□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.69□□□□□ -1.02
IFT27-211ENST00000495555 RNF182Q8N6D2 247 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms