RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493976.1

AKAP9-215, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 3

Gene AKAP9, Length 724 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-215	ENST00000493976	CCNK	O75909	580 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	AP3S2	P59780	193 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	AKR1C1	Q04828	323 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	OXA1L	Q15070	435 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	RRN3P1	Q2M238	152 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976		H3BRN7	92 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	11.22	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	CCDC190	Q86UF4	302 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	BAP18	Q8IXM2	172 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	FAM210B	Q96KR6	192 aa		11.22	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	UHRF2	Q96PU4	802 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		11.21	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
AKAP9-215	ENST00000493976	MUC4	Q99102	2169 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	IFNA21	P01568	189 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	DAD1	P61803	113 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	ID3	Q02535	119 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	FGL1	Q08830	312 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	SRR	Q9GZT4	340 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		11.2	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	C9orf170	A2RU37	121 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	SMCO3	A2RU48	225 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	SSSCA1	O60232	199 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	INS	P01308	110 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	AZU1	P20160	251 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	GPR82	Q96P67	336 aa		11.19	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	IL5	P05113	134 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	LINC00869	P0C866	280 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	MED14OS	P0DP75	135 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	FCN2	Q15485	313 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	BAK1	Q16611	211 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	RNF212	Q495C1	297 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	ZNF738	Q8NE65	137 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		11.18	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	CXCL3	P19876	107 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	S100A5	P33763	92 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	BTC	P35070	178 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	PLP1	P60201	277 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	PATE2	Q6UY27	113 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	ZNF575	Q86XF7	245 aa		11.17	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976		A0A087X0K7	114 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	CCDC160	A6NGH7	325 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	HYPM	O75409	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	NDUFB6	O95139	128 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	OR5G3	P0C626	314 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		11.16	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	LYRM9	A8MSI8	78 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	OR4E1	P0C645	316 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	DEFB130B	P0DP73	79 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	DEFB130A	P0DP74	79 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	TSPO	P30536	169 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	RAP2B	P61225	183 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	SMIM8	Q96KF7	97 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	ARL6	Q9H0F7	186 aa		11.15	□□□□□ -0.62
AKAP9-215	ENST00000493976	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms