RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	OR5AS1	Q8N127	324 aa		-0.84	□□□□□ -2.54
TTC3-222	ENST00000491952	MUCL1	Q96DR8	90 aa		-0.84	□□□□□ -2.54
TTC3-222	ENST00000491952	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		-0.84	□□□□□ -2.54
TTC3-222	ENST00000491952	C8orf76	Q96K31	380 aa		-0.84	□□□□□ -2.54
TTC3-222	ENST00000491952	USE1	Q9NZ43	259 aa		-0.84	□□□□□ -2.54
TTC3-222	ENST00000491952	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		-0.84	□□□□□ -2.54
TTC3-222	ENST00000491952	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		-0.84	□□□□□ -2.54
TTC3-222	ENST00000491952	OBSL1	O75147	1896 aa		-0.84	□□□□□ -2.54
TTC3-222	ENST00000491952		M0R233	179 aa		-0.85	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	TTR	P02766	147 aa		-0.85	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	-0.85	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952		Q6Q795	121 aa		-0.85	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		-0.85	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	MIA2	Q96PC5	1412 aa		-0.85	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	KIFC1	Q9BW19	673 aa		-0.85	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	-0.85	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	-0.86	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	-0.86	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	AP3S2	P59780	193 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	-0.86	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	CASC2	Q6XLA1	102 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	CT55	Q8WUE5	264 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	-0.86	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	-0.86	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	-0.86	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	CACNA1A	O00555	2505 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		-0.86	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	hADV38S2	A0JD32	116 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	ODAM	A1E959	279 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	SULT1A1	P50225	295 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	-0.87	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	ANK2	Q01484	3957 aa		-0.87	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	CACNA1H	O95180	2353 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	-0.88	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	RNF122	Q9H9V4	155 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	-0.88	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	MUC2	Q02817	5179 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	TENM4	Q6N022	2769 aa		-0.88	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	ABCA4	P78363	2273 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	NCOA1	Q15788	1441 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	C9orf170	A2RU37	121 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952		J3QRK9	145 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	C8G	P07360	202 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	CAV3	P56539	151 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	-0.89	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	OR6V1	Q8N148	313 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		-0.89	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952		A0A087WUJ7	227 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	CLDN24	A6NM45	220 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	IFNA5	P01569	189 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	LRP2	P98164	4655 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	TMED1	Q13445	227 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	-0.9	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	PATE2	Q6UY27	113 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	-0.9	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	PTPRD	P23468	1912 aa		-0.9	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	-0.9	□□□□□ -2.55
TTC3-222	ENST00000491952	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	-0.91	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	IFNA16	P05015	189 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	PIGP	P57054	158 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	-0.91	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	RRN3P1	Q2M238	152 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	S100A7A	Q86SG5	101 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	YPEL2	Q96QA6	119 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	ARL5A	Q9Y689	179 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	-0.91	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		-0.91	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	SERPINA6	P08185	405 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	OR10J4	P0C629	311 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	SERPINB9	P50453	376 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	BORCS7	Q96B45	105 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	MALSU1	Q96EH3	234 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	-0.92	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	GLTP	Q9NZD2	209 aa		-0.92	□□□□□ -2.56
TTC3-222	ENST00000491952	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		-0.92	□□□□□ -2.56

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