RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 HIST1H2BHQ93079 126 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 HIST1H2BNQ99877 126 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 HIST1H2BMQ99879 126 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZRM9 215 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 C1QL4Q86Z23 238 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 PRADC1Q9BSG0 188 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 ZNF415Q09FC8 603 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 PSG3Q16557 428 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 LCN12Q6JVE5 192 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 C14orf144Q96I85 54 aa13.81□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 A0A1W2PPI3 338 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 NDUFB8O95169 186 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 IGFL2Q6UWQ7 119 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 RCHY1Q96PM5 261 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 TMEM14BQ9NUH8 114 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 ZNF329Q86UD4 541 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 NDUFA3O95167 84 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 MALP21145 153 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 LOXP28300 417 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 LINC00205P59089 165 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa13.8□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 DPM2O94777 84 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 WISP1O95388 367 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 JKAMPQ9P055 326 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 ZNF524Q96C55 264 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 POLEQ07864 2286 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 WDR86Q86TI4 376 aa13.79□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 NDPQ00604 133 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 KIR3DL3Q8N743 410 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 SMPXQ9UHP9 88 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 SLX1AQ9BQ83 275 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 KAAG1Q9UBP8 84 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 C17orf58Q2M2W7 97 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 NIT1Q86X76 327 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 MYLKQ15746 1914 aa13.78□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 NOTCH4Q99466 2003 aa13.77□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa13.77□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 CA1P00915 261 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 RBMY1CP0DJD4 496 aa13.77□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 TCF15Q12870 199 aa13.77□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 LRRK1Q38SD2 2015 aa13.77□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 ZNF407Q9C0G0 2248 aa13.77□□□□□ -0.2
NISCH-213ENST00000489895 GHRHP01286 108 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 INSP01308 110 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 CD28P10747 220 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 FCN3O75636 299 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 CRPP02741 224 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 COLCA2A8K830 154 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 UBE2CO00762 179 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 IGLV3-1P01715 115 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 FER1L5A0AVI2 2057 aa13.77□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 ATP6V0E1O15342 81 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 WFDC12Q8WWY7 111 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 CHCHD5Q9BSY4 110 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 ACTL10Q5JWF8 245 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 REG4Q9BYZ8 158 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 DPH3P1Q9H4G8 78 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 OVOL3O00110 214 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 SH2D1AO60880 128 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 LYZL1Q6UWQ5 148 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 IFI27L1Q96BM0 104 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 Q96MF0 132 aa13.76□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 ABCA4P78363 2273 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 LAGE3Q14657 143 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 RNF138Q8WVD3 245 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 SCGB1A1P11684 91 aa13.75□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 MPDZO75970 2070 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 RNF182Q8N6D2 247 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 OR9G4Q8NGQ1 327 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 DERL1Q9BUN8 251 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 EVI2AP22794 236 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 PKDREJQ9NTG1 2253 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 AMBPP02760 352 aa13.74□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 SLC25A2Q9BXI2 301 aa13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms