RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 FOLR2P14207 255 aa8.89□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 BLOC1S1P78537 153 aa8.89□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 TM4SF20Q53R12 229 aa8.89□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 KHDC3LQ587J8 217 aa8.89□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.89□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.89□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 ZNF767PQ75MW2 155 aa8.89□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.89□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.89□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.89□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 DOK5Q9P104 306 aa8.89□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 UBQLN2Q9UHD9 624 aa8.89□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.88□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 CHEK1O14757 476 aa8.88□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 HBE1P02100 147 aa8.88□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 CSN3P07498 182 aa8.88□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 GALR1P47211 349 aa8.88□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 RAB2AP61019 212 aa8.88□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 GUK1Q16774 197 aa8.88□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.88□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 ALKAL2Q6UX46 152 aa8.88□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.88□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.88□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 RAB24Q969Q5 203 aa8.88□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 CXorf1O96002 111 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 STAG3L2P0CL84 134 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 STAG3L3P0CL85 134 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 CD33P20138 364 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 IL34Q6ZMJ4 242 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 GLMPQ8WWB7 406 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 UHRF2Q96PU4 802 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 RFNGQ9Y644 331 aa8.87□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.86□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.86□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 PPT1P50897 306 aa8.86□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 PAFAH1B2P68402 229 aa8.86□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.86□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 MRAPQ8TCY5 172 aa8.86□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.86□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.86□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 OR51M1Q9H341 326 aa8.86□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.86□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.86□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 A0A087X0K7 114 aa8.85□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 ZNF253O75346 499 aa8.85□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 SAP30O75446 220 aa8.85□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 PSMB3P49720 205 aa8.85□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 RAB14P61106 215 aa8.85□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 PMS2P11Q13670 270 aa8.85□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 PDE6HQ13956 83 aa8.85□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.85□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.85□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.85□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.85□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 PAXXQ9BUH6 204 aa8.85□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.85□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 HRH4Q9H3N8 390 aa8.85□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 SLC25A22Q9H936 323 aa8.85□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.85□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.84□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 TSPAN4O14817 238 aa8.84□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 OR7C2O60412 319 aa8.84□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 IGLV1-51P01701 117 aa8.84□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 GP9P14770 177 aa8.84□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 ZNF726P1Q15940 193 aa8.84□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.84□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 LCN12Q6JVE5 192 aa8.84□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.84□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 TCF24Q7RTU0 167 aa8.84□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.84□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 SUN5Q8TC36 379 aa8.84□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.84□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.84□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 MLXQ9UH92 298 aa8.84□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.84□□□□□ -0.99
NISCH-211ENST00000488243 ZNF785A8K8V0 405 aa8.83□□□□□ -1
NISCH-211ENST00000488243 RGS13O14921 159 aa8.83□□□□□ -1
NISCH-211ENST00000488243 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
NISCH-211ENST00000488243 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.83□□□□□ -1
NISCH-211ENST00000488243 IGLC2P0DOY2 106 aa8.83□□□□□ -1
NISCH-211ENST00000488243 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.83□□□□□ -1
NISCH-211ENST00000488243 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119.5 ms