RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486199.5

PHF20L1-215, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, human

TSL 2

Gene PHF20L1, Length 1,633 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20L1-215	ENST00000486199		Q8N976	141 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PHF20L1-215	ENST00000486199	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PHF20L1-215	ENST00000486199	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PHF20L1-215	ENST00000486199	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PHF20L1-215	ENST00000486199	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PHF20L1-215	ENST00000486199	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PHF20L1-215	ENST00000486199	FAM60A	Q9NP50	221 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PHF20L1-215	ENST00000486199	TSC2	P49815	1807 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20L1-215	ENST00000486199	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PHF20L1-215	ENST00000486199	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHF20L1-215	ENST00000486199		A0A1B0GW64	132 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199		A6NDX4	124 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	GNG7	O60262	68 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	IGHV1-46	P01743	117 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	IFNA4	P05014	189 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	OR5AC1	P0C628	307 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	SSX8	Q7RTT4	187 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	DAND5	Q8N907	189 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199		Q8N9W7	124 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.09	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	PI4KA	P42356	2102 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	CIT	O14578	2027 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	IRGM	A1A4Y4	181 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	BCL2L11	O43521	198 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	VEGFC	P49767	419 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	OR5W2	Q8NH69	310 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	TRIP11	Q15643	1979 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	PTPRD	P23468	1912 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	NOTCH2	Q04721	2471 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	PTPN13	Q12923	2485 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	MGA	Q8IWI9	3026 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199		F6UZH7	168 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	GABARAP	H6UMI1	98 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	NDUFB2	O95178	105 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199		P0DMU3	169 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	FAM231A	P0DMU4	169 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	FAM231C	P0DMU5	169 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	BIK	Q13323	160 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	TMEM106A	Q96A25	262 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	VGLL1	Q99990	258 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	OTOR	Q9NRC9	128 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	SCN1A	P35498	2009 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	PTPRB	P23467	1997 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	KNTC1	P50748	2209 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	TP53I11	O14683	189 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	SLC22A1	O15245	554 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	HRAS	P01112	189 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	KRAS	P01116	189 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	SLPI	P03973	132 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	CD28	P10747	220 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	NPPC	P23582	126 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	TAS2R20	P59543	309 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PHF20L1-215	ENST00000486199	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms