RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478080.5

CDHR3-211, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CDHR3, Length 2,633 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-211ENST00000478080 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.96□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.96□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 OOSP1A8MZH6 123 aa6.96□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 VWC2LB2RUY7 222 aa6.96□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 H3BRN7 92 aa6.96□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 FAM106CPP0CH98 169 aa6.96□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 CRISP2P16562 243 aa6.96□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 MFAP4P55083 255 aa6.96□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 ECSCRQ19T08 205 aa6.96□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.96□□□□□ -1.3
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CDHR3-211ENST00000478080 GPR82Q96P67 336 aa6.96□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
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CDHR3-211ENST00000478080 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.95□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.95□□□□□ -1.3
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CDHR3-211ENST00000478080 EREGO14944 169 aa6.95□□□□□ -1.3
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CDHR3-211ENST00000478080 TCF24Q7RTU0 167 aa6.95□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 TMEM219Q86XT9 240 aa6.95□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 NUP35Q8NFH5 326 aa6.95□□□□□ -1.3
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CDHR3-211ENST00000478080 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.95□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 MLST8Q9BVC4 326 aa6.95□□□□□ -1.3
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CDHR3-211ENST00000478080 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.95□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.95□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.95□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.95□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.95□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.95□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 G3V318 75 aa6.95□□□□□ -1.3
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CDHR3-211ENST00000478080 ATP6V0E1O15342 81 aa6.95□□□□□ -1.3
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CDHR3-211ENST00000478080 IGLV2-11P01706 119 aa6.95□□□□□ -1.3
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CDHR3-211ENST00000478080 PRNTQ86SH4 94 aa6.95□□□□□ -1.3
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CDHR3-211ENST00000478080 TMEM68Q96MH6 324 aa6.95□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 NEU1Q99519 415 aa6.95□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 OTORQ9NRC9 128 aa6.95□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
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CDHR3-211ENST00000478080 HIGD1CA8MV81 97 aa6.94□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 M0R3E3 92 aa6.94□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 AMY1AP04745 511 aa6.94□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 IGLC2P0DOY2 106 aa6.94□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.94□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.94□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.94□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.94□□□□□ -1.3
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CDHR3-211ENST00000478080 TCAPO15273 167 aa6.94□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 HLA-DRB1P01911 266 aa6.94□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 CTSGP08311 255 aa6.94□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 SLAQ13239 276 aa6.94□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.94□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 BAGE3Q86Y29 109 aa6.94□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.94□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 FMC1Q96HJ9 113 aa6.94□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.94□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.94□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF785A8K8V0 405 aa6.93□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 SCGB1D1O95968 90 aa6.93□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 CAMPP49913 170 aa6.93□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 IQCJQ1A5X6 159 aa6.93□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 Q6ZWC4 215 aa6.93□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 Q86TA4 180 aa6.93□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 MS4A10Q96PG2 267 aa6.93□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 RCHY1Q96PM5 261 aa6.93□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 SRIP30626 198 aa6.93□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 BRS3P32247 399 aa6.93□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 C15orf32Q32M92 178 aa6.93□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.93□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 TSKUQ8WUA8 353 aa6.93□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 GTSF1Q8WW33 167 aa6.93□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 C1RLQ9NZP8 487 aa6.93□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.92□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.92□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.92□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 GPR183P32249 361 aa6.92□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 WDR73Q6P4I2 378 aa6.92□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 THYN1Q9P016 225 aa6.92□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.92□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.92□□□□□ -1.3
CDHR3-211ENST00000478080 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.92□□□□□ -1.3
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