RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477552.1

PTPRD-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRD, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-209ENST00000477552 LINC00614P0C842 121 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 C3orf79P0CE67 100 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 CTRLP40313 264 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 SPATA45Q537H7 98 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 PET117Q6UWS5 81 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 Q8N6K4 173 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 LINC01560Q8TB33 94 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 LINC00479Q96M42 142 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 PSG8Q9UQ74 426 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 A0A1B0GV90 55 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 SPINK4O60575 86 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 TOX4O94842 621 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 PPBPP02775 128 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 IL4P05112 153 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 NTF3P20783 257 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 PLA2G5P39877 138 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 CAMPP49913 170 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 UBE2E1P51965 193 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 GNG5P63218 68 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 HES1Q14469 280 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 NIT1Q86X76 327 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 FAM168AQ92567 244 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 DPF1Q92782 380 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 RITA1Q96K30 269 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 RABAC1Q9UI14 185 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 DMDP11532 3685 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 A0A087X0K7 114 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 F2Z2F3 143 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 LEPROTL1O95214 131 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 PLAUP00749 431 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 IGLV2-11P01706 119 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 IGLC3P0DOY3 106 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 FOSL1P15407 271 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 CNTFRP26992 372 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 EFNA4P52798 201 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 ARF6P62330 175 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 SLC35B1P78383 322 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 Q56UQ5 140 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 PRNTQ86SH4 94 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 A0A1B0GUS0 222 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 SIAH2O43255 324 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 IGHV3-48P01763 117 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 TMEM11P17152 192 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 RCHY1Q96PM5 261 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 APC2O95996 2303 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 AKAP13Q12802 2813 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 ROS1P08922 2347 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 TMEM189A5PLL7 270 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 C2orf70A6NJV1 201 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 A6NNC1 897 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 BRI3O95415 125 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 CDKN1AP38936 164 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 Q6ZN92 141 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 FA2HQ7L5A8 372 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 TCF24Q7RTU0 167 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 Q8N976 141 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRD-209ENST00000477552 GTSF1Q8WW33 167 aa6.59□□□□□ -1.35
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