RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475103.5

RBMS1-210, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 3

Gene RBMS1, Length 414 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-210	ENST00000475103	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	YIF1A	O95070	293 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	LY6G6D	O95868	133 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	FBP1	P09467	338 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	LINC00869	P0C866	280 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	LCN2	P80188	198 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	PAX2	Q02962	417 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	KLRD1	Q13241	179 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	GAMT	Q14353	236 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	TNXA	Q16473	311 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	PRSS8	Q16651	343 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	FBXL15	Q9H469	300 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	ABCA4	P78363	2273 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	BSN	Q9UPA5	3926 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	TNC	P24821	2201 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	ODF3B	A8MYP8	253 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	OOSP1	A8MZH6	123 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103		M0R036	132 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	FOXH1	O75593	365 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	IFNA1	P01562	189 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	OR10J1	P30954	320 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	PSMB3	P49720	205 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	CEBPG	P53567	150 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	WT1-AS	Q06250	92 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	SSX2	Q16385	188 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	P2RX4	Q99571	388 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RBMS1-210	ENST00000475103	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103		H3BQ15	152 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	VENTX	O95231	258 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	CNIH1	O95406	144 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	MOS	P00540	346 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	REG1A	P05451	166 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	BCL2	P10415	239 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	CD24	P25063	80 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	PAX6	P26367	422 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	UBE2E1	P51965	193 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	ATP5J2	P56134	94 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	B2M	P61769	119 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	RHOB	P62745	196 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	EBI3	Q14213	229 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	PLGLA	Q15195	96 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	NPB	Q8NG41	125 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	ACY3	Q96HD9	319 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	TBX15	Q96SF7	602 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	CCL19	Q99731	98 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	LAMA5	O15230	3695 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RBMS1-210	ENST00000475103	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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