RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 SCN3AQ9NY46 2000 aa2.15□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 ARAP1Q96P48 1450 aa2.15□□□□□ -2.06
RABGGTB-205ENST00000462042 K7ERJ3 54 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 UBL3O95164 117 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 BCL2P10415 239 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 MYL5Q02045 173 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 DEFB113Q30KQ7 82 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC00471Q8N535 108 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC00311Q8N616 119 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC00301Q8NCQ3 95 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 Q96M85 177 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 HSPB11Q9Y547 144 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 SORL1Q92673 2214 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 CR1P17927 2039 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 ALPK2Q86TB3 2170 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 MYOFQ9NZM1 2061 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 C2orf70A6NJV1 201 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 LYZL6O75951 148 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 CRPP02741 224 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 S100A11P31949 105 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 IFT20Q8IY31 132 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 ISOC1Q96CN7 298 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 OR2H1Q9GZK4 316 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 C14orf132Q9NPU4 83 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 MED31Q9Y3C7 131 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 CEP192Q8TEP8 1941 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 RGS12O14924 1447 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 MYLKQ15746 1914 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 NISCHQ9Y2I1 1504 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 B4DSR2 109 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 GABARAPH6UMI1 98 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 PROSCO94903 275 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM107AO95990 144 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 ROMO1P60602 79 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 HBBP68871 147 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 PDE6HQ13956 83 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 CROCCP2Q86T23 111 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 C12orf29Q8N999 325 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 NAT8BQ9UHF3 227 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 BCL9O00512 1426 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 SDK1Q7Z5N4 2213 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 F8W036 122 aa2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 OR1I1O60431 355 aa2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 HIST1H2BKO60814 126 aa2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 CST7O76096 145 aa2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 IGLV1-51P01701 117 aa2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 HIST1H2BJP06899 126 aa2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 RETNLBQ9BQ08 111 aa2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 ARHGEF11O15085 1522 aa2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A087WX48 190 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 GPX1P07203 203 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 SCGB1A1P11684 91 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF714Q96N38 554 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 BATF3Q9NR55 127 aa2.11□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 FHAD1B1AJZ9 1412 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 RPL35P42766 123 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 C10orf55Q5SWW7 151 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 TAF9BQ9HBM6 251 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 RER1O15258 196 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 IFNA4P05014 189 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM35BQ8NCS4 154 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 OR5D16Q8NGK9 328 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 SFT2D1Q8WV19 159 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 JPT1Q9UK76 154 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 LY96Q9Y6Y9 160 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGGTB-205ENST00000462042 RTL9Q8NET4 1388 aa2.09□□□□□ -2.08
RABGGTB-205ENST00000462042 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa2.09□□□□□ -2.08
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa2.08□□□□□ -2.08
RABGGTB-205ENST00000462042 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
RABGGTB-205ENST00000462042 DHFRP00374 187 aa2.08□□□□□ -2.08
RABGGTB-205ENST00000462042 ARPC4P59998 168 aa2.08□□□□□ -2.08
RABGGTB-205ENST00000462042 KLRD1Q13241 179 aa2.08□□□□□ -2.08
RABGGTB-205ENST00000462042 Q8N2B8 174 aa2.08□□□□□ -2.08
RABGGTB-205ENST00000462042 Q8N814 137 aa2.08□□□□□ -2.08
RABGGTB-205ENST00000462042 OR2T35Q8NGX2 323 aa2.08□□□□□ -2.08
RABGGTB-205ENST00000462042 OR4K15Q8NH41 348 aa2.08□□□□□ -2.08
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