RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 EPM2AB3EWF7 344 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 H7C1H1 209 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 PEX7O00628 323 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 CEP290O15078 2479 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 EDIL3O43854 480 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 TRACP01848 142 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 IGHMP01871 453 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 APOC2P02655 101 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 CD3DP04234 171 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 SRP19P09132 144 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF688P0C7X2 276 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 CRISP2P16562 243 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 PRSS3P35030 304 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 GNB2P62879 340 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 CXCL6P80162 114 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 FUT5Q11128 374 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 Q5XG85 94 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 SGPP2Q8IWX5 399 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 ATOH7Q8N100 152 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 ANKRD29Q8N6D5 301 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 LRRC29Q8WV35 223 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 NUP205Q92621 2012 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 BORCS8Q96FH0 119 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 KCNS1Q96KK3 526 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 LINC00479Q96M42 142 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 PRELID3AQ96N28 172 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 DOCK7Q96N67 2140 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 NMES1Q9C002 83 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 MYO10Q9HD67 2058 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 C21orf62Q9NYP8 219 aa2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM131Q92545 1883 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 XIRP2A4UGR9 3374 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM24AA6NFZ4 105 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 A8MT66 165 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 H0Y9J4 135 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 LYZL6O75951 148 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 SMIM13P0DJ93 91 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 NMUP48645 174 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 PSMB2P49721 201 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 HERVK_113P61574 105 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 FOXF1Q12946 379 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF141Q15928 474 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 RRN3P1Q2M238 152 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 ETDBQ3ZM63 59 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 Q56UQ5 140 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM201AQ5SY85 155 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 FKBP1CQ5VVH2 108 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF493Q6ZR52 646 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 TCF23Q7RTU1 214 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM256Q8N2U0 113 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 OR8B3Q8NGG8 313 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM213BQ8TBF2 198 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 LMX1AQ8TE12 382 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 AQP3Q92482 292 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 ELSPBP1Q96BH3 223 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 NEURL3Q96EH8 262 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 LINC00526Q96FQ7 95 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 MCEEQ96PE7 176 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 C20orf78Q9BR46 151 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 PAXXQ9BUH6 204 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF702PQ9H963 129 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 CYTL1Q9NRR1 136 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 TAAR3PQ9P1P4 343 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 MTFP1Q9UDX5 166 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 MOB4Q9Y3A3 225 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 HES2Q9Y543 173 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 PXMP4Q9Y6I8 212 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 SCN8AQ9UQD0 1980 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 KMT2EQ8IZD2 1858 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 NUP98P52948 1817 aa2.54□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 DUOX1Q9NRD9 1551 aa2.53□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 DOCK3Q8IZD9 2030 aa2.53□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 MCM3APO60318 1980 aa2.53□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 MYLKQ15746 1914 aa2.53□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa2.53□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 GRIFINA4D1Z8 144 aa2.53□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 SHISA9B4DS77 424 aa2.53□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 M0R2P5 195 aa2.53□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF737O75373 536 aa2.53□□□□□ -2
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 197 ms