RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 LYPD6BQ8NI32 183 aa12.9□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa12.9□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC25A2Q9BXI2 301 aa12.9□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM14CQ9P0S9 112 aa12.9□□□□□ -0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 C2orf70A6NJV1 201 aa12.89□□□□□ -0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 M0QZ24 198 aa12.89□□□□□ -0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 OVOL1O14753 267 aa12.89□□□□□ -0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ARL14EPLP0DKL9 152 aa12.89□□□□□ -0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa12.89□□□□□ -0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHEK1O14757 476 aa12.88□□□□□ -0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 C16orf54Q6UWD8 224 aa12.88□□□□□ -0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL34Q6ZMJ4 242 aa12.88□□□□□ -0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CD5P06127 495 aa12.87□□□□□ -0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 FOLR2P14207 255 aa12.87□□□□□ -0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PSMB3P49720 205 aa12.87□□□□□ -0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00482Q8N8I6 264 aa12.87□□□□□ -0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa12.87□□□□□ -0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa12.86□□□□□ -0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa12.86□□□□□ -0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa12.86□□□□□ -0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 HELTA6NFD8 242 aa12.86□□□□□ -0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 CSN3P07498 182 aa12.86□□□□□ -0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 MEOX2P50222 304 aa12.85□□□□□ -0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 GUK1Q16774 197 aa12.85□□□□□ -0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa12.85□□□□□ -0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 FXYD5Q96DB9 178 aa12.84□□□□□ -0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A087X0K7 114 aa12.83□□□□□ -0.36
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TOP3BP1-201ENST00000420768 EDN2P20800 178 aa12.83□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCL20P78556 96 aa12.83□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa12.83□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFNA1P01562 189 aa12.82□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDE6HQ13956 83 aa12.82□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCF24Q7RTU0 167 aa12.82□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 DYNLRB2Q8TF09 96 aa12.82□□□□□ -0.36
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MLXQ9UH92 298 aa12.82□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa12.82□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa12.82□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRBV19A0A075B6N1 114 aa12.81□□□□□ -0.36
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TOP3BP1-201ENST00000420768 H3BQ15 152 aa12.81□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM90A2PQ658T7 463 aa12.81□□□□□ -0.36
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF586Q9NXT0 402 aa12.81□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATRQ13535 2644 aa12.81□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF253O75346 499 aa12.81□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPL11P62913 178 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 SAMD13Q5VXD3 122 aa12.81□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 GNG13Q9P2W3 67 aa12.81□□□□□ -0.36
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SAP30O75446 220 aa12.8□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 DEFB114Q30KQ6 69 aa12.8□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 LYPD1Q8N2G4 141 aa12.8□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 WFDC9Q8NEX5 89 aa12.8□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 BLNKQ8WV28 456 aa12.8□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM210AQ96ND0 272 aa12.8□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 NRN1Q9NPD7 142 aa12.8□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV25A0A0B4J276 109 aa12.79□□□□□ -0.36
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC00862A6NCI5 91 aa12.79□□□□□ -0.36
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