RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 WDR86Q86TI4 376 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 LY96Q9Y6Y9 160 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF138P52744 262 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 NOTCH3Q9UM47 2321 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1W2PPI3 338 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF688P0C7X2 276 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 USMG5Q96IX5 58 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 DOCK9Q9BZ29 2069 aa17.37■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 APOMO95445 188 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 TOMM40O96008 361 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC25A16P16260 332 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 HIST3H2BBQ8N257 126 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 BEND2Q8NDZ0 799 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 DPM2O94777 84 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF329Q86UD4 541 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 DPH3Q96FX2 82 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 ERVK11-1P61568 191 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 Q8TAT8 98 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 LYZL1Q6UWQ5 148 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 IFI27L1Q96BM0 104 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 LYPD1Q8N2G4 141 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 NDUFAF3Q9BU61 184 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 LINC00587B1AMM8 73 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 LCN12Q6JVE5 192 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 PSG3Q16557 428 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 AMBPP02760 352 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 TDGF1P13385 188 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 RASL11AQ6T310 242 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 PIP4P2Q8N4L2 257 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa17.34■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 NCR2O95944 276 aa17.33■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF562Q6V9R5 426 aa17.33■□□□□ 0.37
PTPRJ-201ENST00000418331 IGLV1-44P01699 117 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 CNTFRP26992 372 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 LIME1Q9H400 295 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM223BA6NKX1 122 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 SAP30O75446 220 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 SCGB1A1P11684 91 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 IGFL4Q6B9Z1 124 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM223AQ8IWN6 122 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM14BQ9NUH8 114 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 PRR31Q5SQ13 230 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 LINC01356Q8N9X3 169 aa17.33■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 D6R8Y8 96 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 MED13LQ71F56 2210 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 NDUFS8O00217 210 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 SH2D1AO60880 128 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM215AQ9Y5M1 114 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM90A2PQ658T7 463 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 NUP35Q8NFH5 326 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 LINC00477Q96M19 166 aa17.32■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 PIP4P1Q86T03 277 aa17.31■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 GTSCR1Q86UQ5 136 aa17.31■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 UBE2E1P51965 193 aa17.31■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 FCN3O75636 299 aa17.31■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 FRMPD3Q5JV73 1810 aa17.31■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 C17orf58Q2M2W7 97 aa17.3■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa17.3■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 CD28P10747 220 aa17.3■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa17.3■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 CFAP161Q6P656 301 aa17.3■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 PCNX2A6NKB5 2137 aa17.3■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 LOXP28300 417 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 DOCK10Q96BY6 2186 aa17.29■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa17.29■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 KIAA1671Q9BY89 1806 aa17.29■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 IGKCP01834 107 aa17.29■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 ADCYAP1P18509 176 aa17.29■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 MST1LQ2TV78 715 aa17.29■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 SPCS1Q9Y6A9 102 aa17.29■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 MSMBP08118 114 aa17.29■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 PAX9P55771 341 aa17.29■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 BDP1A6H8Y1 2624 aa17.29■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa17.29■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 ACTL10Q5JWF8 245 aa17.29■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa17.29■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 IGLV3-1P01715 115 aa17.28■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 LAGE3Q14657 143 aa17.28■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa17.28■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa17.28■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 IGKV1-39P01597 117 aa17.28■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 IGKV1D-39P04432 117 aa17.28■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1B0GWB2 263 aa17.28■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 CFHR2P36980 270 aa17.28■□□□□ 0.36
PTPRJ-201ENST00000418331 LINC00479Q96M42 142 aa17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.2 ms