RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409025.5

USP39-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP39, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-202ENST00000409025 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
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USP39-202ENST00000409025 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
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USP39-202ENST00000409025 SRD5A3Q9H8P0 318 aa14.73□□□□□ -0.05
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USP39-202ENST00000409025 LYPD1Q8N2G4 141 aa14.72□□□□□ -0.05
USP39-202ENST00000409025 CMTM2Q8TAZ6 248 aa14.72□□□□□ -0.05
USP39-202ENST00000409025 OSTCQ9NRP0 149 aa14.72□□□□□ -0.05
USP39-202ENST00000409025 KLF12Q9Y4X4 402 aa14.72□□□□□ -0.05
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USP39-202ENST00000409025 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa14.72□□□□□ -0.05
USP39-202ENST00000409025 FMC1Q96HJ9 113 aa14.72□□□□□ -0.05
USP39-202ENST00000409025 ZNF414Q96IQ9 312 aa14.72□□□□□ -0.05
USP39-202ENST00000409025 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
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USP39-202ENST00000409025 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa14.71□□□□□ -0.05
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USP39-202ENST00000409025 C17orf77Q96MU5 243 aa14.71□□□□□ -0.05
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USP39-202ENST00000409025 PTPN13Q12923 2485 aa14.71□□□□□ -0.05
USP39-202ENST00000409025 SLC17A3O00476 420 aa14.7□□□□□ -0.06
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USP39-202ENST00000409025 RELQ04864 619 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 PDE6HQ13956 83 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 C9orf139Q6ZV77 190 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 V9GYV3 84 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 TYMSP04818 313 aa14.7□□□□□ -0.06
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USP39-202ENST00000409025 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 Q6ZS46 218 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 SMIM12Q96EX1 92 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 POLQO75417 2590 aa14.7□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 RPEL1Q2QD12 228 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 OR8I2Q8N0Y5 310 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 USMG5Q96IX5 58 aa14.69□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa14.68□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 ZNF320A2RRD8 509 aa14.68□□□□□ -0.06
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USP39-202ENST00000409025 SGK494Q96LW2 274 aa14.68□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 ZNF580Q9UK33 172 aa14.68□□□□□ -0.06
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USP39-202ENST00000409025 PSG9Q00887 426 aa14.67□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 AAMDCQ9H7C9 122 aa14.67□□□□□ -0.06
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USP39-202ENST00000409025 Q6YL49 198 aa14.66□□□□□ -0.06
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USP39-202ENST00000409025 FRZBQ92765 325 aa14.66□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa14.66□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 K7EQM0 130 aa14.66□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 HIST1H2BKO60814 126 aa14.66□□□□□ -0.06
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USP39-202ENST00000409025 HIST1H2BJP06899 126 aa14.66□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 HIST1H2BOP23527 126 aa14.66□□□□□ -0.06
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USP39-202ENST00000409025 ARL3P36405 182 aa14.66□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 HIST1H2BDP58876 126 aa14.66□□□□□ -0.06
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USP39-202ENST00000409025 HIST1H2BHQ93079 126 aa14.66□□□□□ -0.06
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USP39-202ENST00000409025 VPREB3Q9UKI3 123 aa14.66□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 NAV2Q8IVL1 2488 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 PHOX2AO14813 284 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 IGLV1-40P01703 118 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 TRGC1P0CF51 173 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 METTL26Q96S19 204 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 CSMD2Q7Z408 3487 aa14.65□□□□□ -0.06
USP39-202ENST00000409025 CLPSL1A2RUU4 121 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-202ENST00000409025 UBE2CO00762 179 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-202ENST00000409025 BUB3O43684 328 aa14.64□□□□□ -0.07
USP39-202ENST00000409025 CFHR3Q02985 330 aa14.64□□□□□ -0.07
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