RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GPR171O14626 319 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RER1O15258 196 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GMDSO60547 372 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATG12O94817 140 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 VAPBO95292 243 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SERPINE1P05121 402 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MGPP08493 103 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 APELAP0DMC3 54 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MIFP14174 115 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AREGP15514 252 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ADCYAP1P18509 176 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RAB11AP62491 216 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NUCB2P80303 420 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 APOFQ13790 326 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GRK1Q15835 563 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LYRM7Q5U5X0 104 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SFXN4Q6P4A7 337 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TAC4Q86UU9 113 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EXOC8Q8IYI6 725 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR2T10Q8NGZ9 312 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SCLT1Q96NL6 688 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLCC1Q96S66 551 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 COPS8Q99627 209 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR8D2Q9GZM6 311 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PXMP2Q9NR77 195 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM242Q9NWH2 141 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MROH2AA6NES4 1674 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EVC2Q86UK5 1308 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TOP2BQ02880 1626 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ABCA6Q8N139 1617 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C3P01024 1663 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A096LPF7 62 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SYCE1LA8MT33 242 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 I3L3M4 83 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PSPHP1O15172 72 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATP5LO75964 103 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IL1BP01584 269 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UCHL1P09936 223 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IAPPP10997 89 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MAP3K7CLP57077 242 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR10A3P58181 314 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RPL30P62888 115 aaKnown RBP-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ADIGQ0VDE8 80 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NEDD8Q15843 81 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RPEL1Q2QD12 228 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 XAF1Q6GPH4 301 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLEC2AQ6UVW9 174 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPESP1Q6UW49 350 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CATSPER4Q7RTX7 472 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CD302Q8IX05 232 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLYBLQ8N0X4 340 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR51Q1Q8NH59 317 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR10A6Q8NH74 314 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCDC110Q8TBZ0 833 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ELOVL3Q9HB03 270 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C14orf132Q9NPU4 83 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HMG20BQ9P0W2 317 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MAD2L2Q9UI95 211 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PYCARDQ9ULZ3 195 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SNX8Q9Y5X2 465 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-3.29□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A0U1RRA0 63 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IRGMA1A4Y4 181 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM183AA6NL82 134 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 J3KT08 172 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SC5DO75845 299 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC2A3P11169 496 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 S100A5P33763 92 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SNU13P55769 128 aaKnown RBP-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RBM11P57052 281 aaKnown RBP-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RHBDL3P58872 404 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DYNLT1P63172 113 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C2orf80Q0P641 193 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GAMTQ14353 236 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CT45A1Q5HYN5 189 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM78Q5T7P6 136 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DPPA2Q7Z7J5 298 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 STX12Q86Y82 276 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRAM1L1Q8N609 369 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NECAB1Q8N987 351 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR5AK2Q8NH90 309 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 VSTM2AQ8TAG5 236 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ASZ1Q8WWH4 475 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ACOT12Q8WYK0 555 aa-3.3□□□□□ -2.94
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CXorf40BQ96DE9 158 aa-3.3□□□□□ -2.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms