RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360428.8

DSC3-201, Transcript of desmocollin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DSC3, Length 6,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3-201ENST00000360428 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa4.86□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 TMEM75Q8N9X5 138 aa4.86□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 SNHG12Q9BXW3 62 aa4.86□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 ZNF492Q9P255 531 aa4.86□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 ZNF319Q9P2F9 582 aa4.86□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 A0A0U1RRA0 63 aa4.86□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 A0A1W2PRX2 142 aa4.86□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 PDE6HQ13956 83 aa4.86□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa4.86□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 FAM201AQ5SY85 155 aa4.86□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 LCN12Q6JVE5 192 aa4.86□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 M0R1W7 72 aa4.85□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 TIMM23O14925 209 aa4.85□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 TAL2Q16559 108 aa4.85□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 IL17RELQ6ZVW7 336 aa4.85□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 PRIMA1Q86XR5 153 aa4.85□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 METRNQ9UJH8 293 aa4.85□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 NCR2O95944 276 aa4.85□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 GLRX5Q86SX6 157 aa4.85□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 ZNF329Q86UD4 541 aa4.85□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa4.85□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 GAGE1Q13065 139 aa4.85□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.85□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 SCRT1Q9BWW7 348 aa4.85□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa4.85□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa4.85□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa4.85□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 MRAPQ8TCY5 172 aa4.85□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 CELA3BP08861 270 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 Q6ZS49 121 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 A8MWP6 167 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 RHODO00212 210 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 NMSQ5H8A3 153 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 TMEM256Q8N2U0 113 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 C9orf106Q8NAJ2 232 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 DSCR8Q96T75 97 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 PSCAO43653 123 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 ATP6V0BQ99437 205 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 MMP23AO75900 390 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 TIAF1O95411 115 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 IGLV3-19P01714 112 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 CELA3AP09093 270 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 C15orf32Q32M92 178 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 PYY3Q5JQD4 70 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 LIME1Q9H400 295 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 ASPMQ8IZT6 3477 aa4.84□□□□□ -1.63
DSC3-201ENST00000360428 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 PRSS46E5RG02 174 aa4.84□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 SIVA1O15304 175 aa4.84□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 CTSBP07858 339 aa4.84□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 CSRP2Q16527 193 aa4.84□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 Q8N8P6 123 aa4.84□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 KNTC1P50748 2209 aa4.84□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 LYPD3O95274 346 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 CD33P20138 364 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 CRYGSP22914 178 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 SLAQ13239 276 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 IGHV1-46P01743 117 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 IGHV1-8P0DP01 117 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 VMO1Q7Z5L0 202 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 BMPERQ8N8U9 685 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 WDFY4Q6ZS81 3184 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 K7EP34 96 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 IGHG4P01861 327 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 SRRM5B3KS81 715 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 I3L3M4 83 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 TCF15Q12870 199 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 TMEM200BQ69YZ2 307 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 Q86TA4 180 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 SPXQ9BT56 116 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 ATG2BQ96BY7 2078 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 H0YJW9 148 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 RPL15P61313 204 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 CFHR1Q03591 330 aa4.83□□□□□ -1.64
DSC3-201ENST00000360428 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.5 ms