RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 NDUFB8O95169 186 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRR-202ENST00000342084 LTAP01374 205 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRR-202ENST00000342084 PPIAL4GP0DN37 164 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRR-202ENST00000342084 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRR-202ENST00000342084 KLRD1Q13241 179 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRR-202ENST00000342084 FAM120AOSQ5T036 256 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRR-202ENST00000342084 PVRIGQ6DKI7 326 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRR-202ENST00000342084 RASL11AQ6T310 242 aa5.77□□□□□ -1.49
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PTPRR-202ENST00000342084 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRR-202ENST00000342084 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRR-202ENST00000342084 B9A039 149 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRR-202ENST00000342084 OVOL3O00110 214 aa5.74□□□□□ -1.49
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PTPRR-202ENST00000342084 MUC21Q5SSG8 566 aa5.74□□□□□ -1.49
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PTPRR-202ENST00000342084 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRR-202ENST00000342084 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRR-202ENST00000342084 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRR-202ENST00000342084 LY6LH3BQJ8 138 aa5.74□□□□□ -1.49
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PTPRR-202ENST00000342084 C8orf49Q96NF6 230 aa5.74□□□□□ -1.49
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PTPRR-202ENST00000342084 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRR-202ENST00000342084 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa5.73□□□□□ -1.49
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PTPRR-202ENST00000342084 H3BRN7 92 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRR-202ENST00000342084 TCF21O43680 179 aa5.73□□□□□ -1.49
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PTPRR-202ENST00000342084 RBPJQ06330 500 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRR-202ENST00000342084 HES1Q14469 280 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRR-202ENST00000342084 CT83Q5H943 113 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRR-202ENST00000342084 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRR-202ENST00000342084 KLHDC1Q8N7A1 406 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRR-202ENST00000342084 SMIM12Q96EX1 92 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRR-202ENST00000342084 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa5.73□□□□□ -1.49
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