RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 HILPDAQ9Y5L2 63 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 RNF223E7ERA6 249 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 SYNGR2O43760 224 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 IGLV2-23P01705 113 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 REG1AP05451 166 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 CT45A10P0DMU9 189 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 CD33P20138 364 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 LGALS4P56470 323 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 OR4B1Q8NGF8 309 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 Q96MF0 132 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 BCL2L11O43521 198 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 GPR137BO60478 399 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 MPDU1O75352 247 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 OR4A5Q8NH83 315 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 FAM213BQ8TBF2 198 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 RITA1Q96K30 269 aa4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 C15orf61A6NNL5 157 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 TIMM23O14925 209 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 IAPPP10997 89 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 IER3P46695 156 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 SULT1A2P50226 295 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 C10orf91Q5T1B1 145 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 ZFAND6Q6FIF0 208 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 ZNF429Q86V71 674 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 DYNAPQ8N1N2 210 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 AJUBAQ96IF1 538 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 LINC00477Q96M19 166 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 ABCA2Q9BZC7 2435 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 FABP5P3A8MUU1 101 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 OOSP1A8MZH6 123 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 HAX1O00165 279 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 UPK2O00526 184 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 NPFFO15130 113 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 ATP5LO75964 103 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 KBTBD11O94819 623 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 TMEM50AO95807 157 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 CXCL1P09341 107 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 RHOGP84095 191 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 ABHD5Q8WTS1 349 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 DUX3Q96PT4 197 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 EDA2RQ9HAV5 297 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 TMEM14BQ9NUH8 114 aa4.84□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.84□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa4.84□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 FAM24AA6NFZ4 105 aa4.84□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 SPINK9Q5DT21 86 aa4.84□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 STHQ8IWL8 128 aa4.84□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 PSENENQ9NZ42 101 aa4.84□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 PRNDQ9UKY0 176 aa4.84□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 CEBPZOSA8MTT3 80 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 IGHV1-69P01742 117 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 IGHV4-31P0DP07 118 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 SAA4P35542 130 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 VMA21Q3ZAQ7 101 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 TIGITQ495A1 244 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 C7orf69Q9H7B7 122 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 CR1P17927 2039 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 APCP25054 2843 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 ISLRO14498 428 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 CNTFRP26992 372 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 IL17DQ8TAD2 202 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 VSTM2AQ8TAG5 236 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 RNF5Q99942 180 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
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CCR6-201ENST00000341935 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 TRAV40A0A0B4J280 105 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 OR4C46A6NHA9 309 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 SMIM17P0DL12 118 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 MYOD1P15172 320 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 RPL8P62917 257 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 PSG5Q15238 335 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 PIP4P2Q8N4L2 257 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 TMEM252Q8N6L7 170 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 CYTL1Q9NRR1 136 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 CENPEQ02224 2701 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 LYSTQ99698 3801 aa4.83□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CCR6-201ENST00000341935 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa4.82□□□□□ -1.64
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