RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 C16orf97H3BN30 126 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 GOSR1O95249 250 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM200BQ69YZ2 307 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 C10orf142B7Z368 130 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 S100A4P26447 101 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 FMC1Q96HJ9 113 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 TIMM23BQ5SRD1 257 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 LCNL1Q6ZST4 164 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 PSG8Q9UQ74 426 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 COL6A3P12111 3177 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 FAM90A27PA6NNH2 459 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 MC5RP33032 325 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 SMAGPQ0VAQ4 97 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 PET117Q6UWS5 81 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM186Q96B77 213 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 C17orf77Q96MU5 243 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 SLC25A15Q9Y619 301 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 LINC00312Q9Y6C7 94 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 PATE2Q6UY27 113 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 SCGB2A1O75556 95 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 TMPRSS3P57727 454 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 ECSCRQ19T08 205 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 FXYD5Q96DB9 178 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRN-201ENST00000295718 J3QR89 54 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 TGFAP01135 160 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 IGLV2-8P01709 118 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 FOXC2Q99958 501 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 NGBQ9NPG2 151 aa11.65□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 KIR3DS1Q14943 382 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM249Q2WGJ8 235 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 LYZL1Q6UWQ5 148 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 GTSF1LQ9H1H1 148 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 NCKAP5O14513 1909 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 A0A0G2JLM5 398 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 PAX1P15863 534 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 BSPH1Q075Z2 132 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 SCGB1D4Q6XE38 83 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM133Q9H2Q1 129 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 CSPG4Q6UVK1 2322 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 CTRLP40313 264 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 ORMDL3Q8N138 153 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 TTTY13Q9BZ97 58 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 TECTAO75443 2155 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 GTSCR1Q86UQ5 136 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 ARL17AQ8IVW1 177 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 C1orf159Q96HA4 380 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 RITA1Q96K30 269 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM265A0A087WTH1 108 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 ESDP10768 282 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 ITGB1BP1O14713 200 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 PPP1R27Q86WC6 154 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 GTSF1Q8WW33 167 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 IFI27L1Q96BM0 104 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 SMIM12Q96EX1 92 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 HIST1H4GQ99525 98 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 SORL1Q92673 2214 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 OR5AN1Q8NGI8 311 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 C17orf100A8MU93 164 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 LY6HO94772 140 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 LGALS7P47929 136 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 C1orf185Q5T7R7 199 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 SPANXN1Q5VSR9 72 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF788Q6ZQV5 615 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 OR4A5Q8NH83 315 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF502Q8TBZ5 544 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 C2orf70A6NJV1 201 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 SMIM13P0DJ93 91 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 CD59P13987 128 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 SPATA12Q7Z6I5 190 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 JKAMPQ9P055 326 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 RABAC1Q9UI14 185 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 PRSS46E5RG02 174 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 TM4SF5O14894 197 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 TAX1BP3O14907 124 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 CD5LO43866 347 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 LEPP41159 167 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 C8orf46Q8TAG6 207 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 C8orf49Q96NF6 230 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRN-201ENST00000295718 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.6 ms