RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 MST1LQ2TV78 715 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 LCN12Q6JVE5 192 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM86BQ8N661 226 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHB2Q96CS7 222 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 A6NNC1 897 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 POLEQ07864 2286 aa17.22■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 DLEU1O43261 78 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 SCN5AQ14524 2016 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0G2JNJ9 132 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 Q9UFV3 132 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 ANAPC10Q9UM13 185 aa17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
CCSAP-201ENST00000284617 VCYO14598 125 aa17.21■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF329Q86UD4 541 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 GFRA4Q9GZZ7 299 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00205P59089 165 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM219Q86XT9 240 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 USMG5Q96IX5 58 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 CHCHD5Q9BSY4 110 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 SIP14410 1827 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 M0R2P5 195 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 ATXN8Q156A1 80 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZS92 163 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 PDE6HQ13956 83 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF876PQ49A33 203 aa17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 Q8TAT8 98 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 hDV102S1A0JD36 115 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 Q86TA4 180 aa17.19■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 LMO1P25800 156 aa17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 ARTNQ5T4W7 220 aa17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 WFDC12Q8WWY7 111 aa17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 RCHY1Q96PM5 261 aa17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 THADAQ6YHU6 1953 aa17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV1-16P04430 117 aa17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 B4DSR2 109 aa17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 GGTLC3B5MD39 225 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 Q0VG73 95 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 DTX2Q86UW9 622 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa17.17■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 WNK2Q9Y3S1 2297 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 H3BUX3 64 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF688P0C7X2 276 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 LY6DQ14210 128 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 MPV17L2Q567V2 206 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 PI4KAP42356 2102 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 FAM223BA6NKX1 122 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 FAM223AQ8IWN6 122 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF664Q8N3J9 261 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 E9PQ18 207 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 C9JQL5 133 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM155Q4W5P6 130 aa17.16■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 CRPP02741 224 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF415Q09FC8 603 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 PRTN3P24158 256 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 MLANAQ16655 118 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 TEX43Q6ZNM6 134 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 HS3ST6Q96QI5 342 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 FAM231BA6NCW3 169 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 PRADC1Q9BSG0 188 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM158Q8WZ71 300 aa17.15■□□□□ 0.34
CCSAP-201ENST00000284617 LYPD2Q6UXB3 125 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0U1RRA0 63 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00158P58513 81 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 ANAPC13Q9BS18 74 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PPI3 338 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 PFN1P07737 140 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF492Q9P255 531 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087X0K7 114 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 NDPQ00604 133 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 PRR31Q5SQ13 230 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM14BQ9NUH8 114 aa17.14■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 AMN1Q8IY45 258 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 RIPPLY3P57055 190 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 CSTL1Q9H114 145 aa17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM249Q2WGJ8 235 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 SBF1O95248 1867 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 FCN3O75636 299 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 CT83Q5H943 113 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 MYO7BQ6PIF6 2116 aa17.12■□□□□ 0.33
CCSAP-201ENST00000284617 RASL10AQ92737 203 aa17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.2 ms