RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 J3QLI3 93 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 HYPMO75409 117 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2J3O76001 311 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 APOA2P02652 100 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 BATFQ16520 125 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 OR9G1Q8NH87 305 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 C22orf15Q8WYQ4 148 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 ONECUT1Q9UBC0 465 aa20.92■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 MYOD1P15172 320 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM200BQ69YZ2 307 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa20.91■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 hADV38S2A0JD32 116 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP20.9■□□□□ 0.942e-6■■■□□ 18.2
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZN92 141 aa20.9■□□□□ 0.94
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CAPNS1-201ENST00000246533 C8orf46Q8TAG6 207 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 SIRPDQ9H106 197 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 ATRQ13535 2644 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL3L1P16619 93 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 SRD5A1P18405 259 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 UTF1Q5T230 341 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 VSTM2AQ8TAG5 236 aa20.9■□□□□ 0.94
CAPNS1-201ENST00000246533 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 PEX7O00628 323 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 COX7A2P2O60397 106 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35B1P78383 322 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 ORAOV1Q8WV07 137 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 PAXXQ9BUH6 204 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00312Q9Y6C7 94 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 FSHBP01225 129 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV1-16P04430 117 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 GNG10P50151 68 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM177Q53S58 311 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 C10orf113Q5VZT2 155 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 MOB3BQ86TA1 216 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 TOX4O94842 621 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 LIPFP07098 398 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL8P62917 257 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM71F2Q6NXP2 309 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF329Q86UD4 541 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 PRIMA1Q86XR5 153 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 HSBP1O75506 76 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 SLAQ13239 276 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 MMDQ15546 238 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf42Q8N5U0 333 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV40A0A0B4J280 105 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 MFAP2P55001 183 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 THAP8Q8NA92 274 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 VMO1Q7Z5L0 202 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 NUP35Q8NFH5 326 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 BRD3OSQ6XYD6 125 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 NUDT10Q8NFP7 164 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5AN1Q8NGI8 311 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 NUDT11Q96G61 164 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 HARBI1Q96MB7 349 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 NTF3P20783 257 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 KLRD1Q13241 179 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM181BA6NEQ2 426 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 CT83Q5H943 113 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC7AQ9BXN2 247 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 DLX6P56179 175 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 DMRTA1Q5VZB9 504 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM190Q8WZ59 177 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 C1RLQ9NZP8 487 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 KLF12Q9Y4X4 402 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPOP30536 169 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-201ENST00000246533 MYCNOSP40205 109 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-201ENST00000246533 PDPNQ86YL7 162 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM19A2Q8N3H0 131 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-201ENST00000246533 C8orf31Q8N9H6 132 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFRSF14Q92956 283 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-201ENST00000246533 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PRD5 423 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PRF3 423 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PRM7 423 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-201ENST00000246533 H0YJW9 148 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-201ENST00000246533 M0R2Z0 102 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-201ENST00000246533 ETFRF1Q6IPR1 90 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10W1Q8NGF6 305 aa20.82■□□□□ 0.92
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