RNA–Protein interactions for RNA: YOR075W

UFE1, Transcript of t-SNARE protein required for retrograde vesicular traffic, yeast

Gene UFE1, Length 1,041 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UFE1	YOR075W	PSF3	Q12146	194 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	SEC12	P11655	471 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	STE12	P13574	688 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	PIH1	P38768	344 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	PAC2	P39937	518 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	YIP4	P53093	235 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	ARO10	Q06408	635 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.69	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	BNR1	P40450	1375 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	CNE1	P27825	502 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	LOT5	P34234	306 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	ATF1	P40353	525 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	PHO3	P24031	467 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	YIL092W	P40497	633 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	MAD2	P40958	196 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	PEX8	P53248	589 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	BUD17	P53727	317 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	CPR8	P53728	308 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	YNL034W	P53963	612 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	YNL018C	P53976	612 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	TGS1	Q12052	315 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	HOS1	Q12214	470 aa		4.67	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	ARG1	P22768	420 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	DSS4	P32601	143 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	TAF5	P38129	798 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	RIM4	P38741	713 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	SAW1	P39735	261 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	YNR071C	P53757	342 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	USA1	Q03714	838 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	GIS1	Q03833	894 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	SND1	Q04007	877 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	NUR1	Q12066	484 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.66	□□□□□ -1.66
UFE1	YOR075W	URA3	P03962	267 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	PCK1	P10963	549 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	TGL1	P34163	548 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	SDS22	P36047	338 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	CCL1	P37366	393 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	YGL117W	P53133	265 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	TGL2	P54857	326 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	TRI1	Q05024	226 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	ULA1	Q12059	462 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	DIN7	Q12086	430 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	NIC96	P34077	839 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	FLO10	P36170	1169 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	GRX7	P38068	203 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	IMO32	P53219	342 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	COQ6	P53318	479 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	WHI2	P12611	486 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	CBP3	P21560	335 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	VPS34	P22543	875 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	YMC1	P32331	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	ATG36	P46983	293 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	ARG7	Q04728	441 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	MPD2	Q99316	277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	BET2	P20133	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	YLF2	P38746	405 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	GSM1	P42950	618 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	ASK10	P48361	1146 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	SAP4	P53036	818 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	HOF1	Q05080	669 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	PMA2	P19657	947 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	FMP30	Q02883	468 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	COQ11	Q05892	277 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	AAD3	P25612	363 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	PEX2	P32800	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	SDH8	P38345	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	COS12	P53053	380 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UFE1	YOR075W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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