RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637121.1

EFHC1-228, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 3

Gene EFHC1, Length 2,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-228	ENST00000637121	TRIM29	Q14134	588 aa		6.09	□□□□□ -1.43
EFHC1-228	ENST00000637121	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		6.09	□□□□□ -1.43
EFHC1-228	ENST00000637121	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		6.09	□□□□□ -1.43
EFHC1-228	ENST00000637121	LPIN2	Q92539	896 aa		6.09	□□□□□ -1.43
EFHC1-228	ENST00000637121	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
EFHC1-228	ENST00000637121	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
EFHC1-228	ENST00000637121	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		6.09	□□□□□ -1.43
EFHC1-228	ENST00000637121	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		6.09	□□□□□ -1.43
EFHC1-228	ENST00000637121	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	PDE8B	O95263	885 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	NT5C2	P49902	561 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	CHADL	Q6NUI6	762 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	NLRP10	Q86W26	655 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	TMTC2	Q8N394	836 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	KRT23	Q9C075	422 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	SLAIN2	Q9P270	581 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	RTL9	Q8NET4	1388 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	CBFA2T2	O43439	604 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	ITGA6	P23229	1130 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	ZAP70	P43403	619 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	MAP3K12	Q12852	859 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	IRF5	Q13568	498 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	ANO1	Q5XXA6	986 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	BCL9	O00512	1426 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		6.08	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	SLC5A1	P13866	664 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	NLRP12	P59046	1061 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	SLC39A14	Q15043	492 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	SPOCK2	Q92563	424 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	FEZ1	Q99689	392 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	DISP2	A7MBM2	1401 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	TNNT1	P13805	278 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	MCAM	P43121	646 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	PARP10	Q53GL7	1025 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	AIDA	Q96BJ3	306 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	DACH1	Q9UI36	760 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	C4A	P0C0L4	1744 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	C4B	P0C0L5	1744 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		6.07	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	FOXP2	O15409	715 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	ZBTB43	O43298	467 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	CUTA	O60888	179 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	ADORA1	P30542	326 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	KANK3	Q6NY19	840 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	APOA5	Q6Q788	366 aa		6.06	□□□□□ -1.44
EFHC1-228	ENST00000637121	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44

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