RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 NLRP3Q96P20 1036 aa21.59■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.58■■□□□ 1.05
CLN8-211ENST00000636934 YEATS4O95619 227 aa21.58■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 CYP7A1P22680 504 aa21.58■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.58■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 LCORLQ8N3X6 602 aa21.58■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.58■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.58■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 LY9Q9HBG7 655 aa21.58■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.58■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.58■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.57■■□□□ 1.04
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CLN8-211ENST00000636934 TMTC2Q8N394 836 aa21.57■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.57■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 RAI14Q9P0K7 980 aa21.57■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 BTAF1O14981 1849 aa21.57■■□□□ 1.04
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CLN8-211ENST00000636934 A0A1W2PQ27 194 aa21.56■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 A0A1W2PQ64 194 aa21.56■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 A0A1W2PQD8 194 aa21.56■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.56■■□□□ 1.04
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CLN8-211ENST00000636934 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.56■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.56■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
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CLN8-211ENST00000636934 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.56■■□□□ 1.04
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CLN8-211ENST00000636934 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.56■■□□□ 1.04
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CLN8-211ENST00000636934 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.56■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 ERICH2A1L162 156 aa21.56■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.56■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 STK38Q15208 465 aa21.56■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
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CLN8-211ENST00000636934 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.56■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.56■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 WASF1Q92558 559 aa21.56■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 GNPATO15228 680 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 PPFIA3O75145 1194 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 TPM3P06753 285 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 GYG1P46976 350 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 RCAN1P53805 252 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 TRIM29Q14134 588 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 ADALQ6DHV7 355 aa21.55■■□□□ 1.04
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CLN8-211ENST00000636934 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 MICU3Q86XE3 530 aa21.54■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.54■■□□□ 1.04
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CLN8-211ENST00000636934 FSIP1Q8NA03 581 aa21.53■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.53■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.53■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.53■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.53■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.53■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.53■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
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CLN8-211ENST00000636934 TOMM22Q9NS69 142 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-211ENST00000636934 COL4A1P02462 1669 aa21.52■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 OFD1O75665 1012 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 PCP11498 1178 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 KCNQ4P56696 695 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 ILDR2Q71H61 639 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 ENGASEQ8NFI3 743 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 CBX8Q9HC52 389 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 SPTLC2O15270 562 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 IGSF3O75054 1194 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-211ENST00000636934 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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