RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601247.5

FCHO1-235, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 458 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-235ENST00000601247 GMLQ99445 158 aa18.28■□□□□ 0.52
FCHO1-235ENST00000601247 TMOD2Q9NZR1 351 aa18.28■□□□□ 0.52
FCHO1-235ENST00000601247 SBF1O95248 1867 aa18.28■□□□□ 0.52
FCHO1-235ENST00000601247 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa18.27■□□□□ 0.52
FCHO1-235ENST00000601247 MYO1BO43795 1136 aa18.27■□□□□ 0.52
FCHO1-235ENST00000601247 USP5P45974 858 aa18.27■□□□□ 0.52
FCHO1-235ENST00000601247 PPP4CP60510 307 aa18.27■□□□□ 0.52
FCHO1-235ENST00000601247 TEX11Q8IYF3 940 aa18.27■□□□□ 0.52
FCHO1-235ENST00000601247 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
FCHO1-235ENST00000601247 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
FCHO1-235ENST00000601247 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 TDO2P48775 406 aa18.26■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 MICALL2Q8IY33 904 aa18.26■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 AMOTL1Q8IY63 956 aa18.26■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 DSCC1Q9BVC3 393 aa18.26■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 USP40Q9NVE5 1235 aa18.26■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 CTNNA3Q9UI47 895 aa18.26■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 DDNO94850 711 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 NAPBQ9H115 298 aa18.25■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 IL25Q9H293 177 aa18.25■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 MYOZ2Q9NPC6 264 aa18.25■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 MYH2Q9UKX2 1941 aa18.24■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 SEC24BO95487 1268 aa18.24■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 RNF20Q5VTR2 975 aa18.24■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 MTMR14Q8NCE2 650 aa18.23■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa18.23■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 GPRC5DQ9NZD1 345 aa18.23■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 GLTPD2A6NH11 291 aa18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 SPDYE2BA6NHP3 402 aa18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 SPDYE6P0CI01 402 aa18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 PTH1RQ03431 593 aa18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 VPS53Q5VIR6 699 aa18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 GIMAP6Q6P9H5 292 aa18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 SDR42E1Q8WUS8 393 aa18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 MAP4K1Q92918 833 aa18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 USP26Q9BXU7 913 aa18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 C22orf23Q9BZE7 217 aa18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 IQCA1LA6NCM1 817 aa18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 PRKAB2O43741 272 aa18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 PICALMQ13492 652 aa18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 IFNL3Q8IZI9 196 aa18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-235ENST00000601247 GSG1L2A8MUP6 293 aa18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 RHBDL3P58872 404 aa18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 ALX1Q15699 326 aa18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 VEZTQ9HBM0 779 aa18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 HACL1Q9UJ83 578 aa18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 ZMYM6O95789 1325 aa18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF213O14771 459 aa18.19■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 TNNI2P48788 182 aa18.19■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 SAMD7Q7Z3H4 446 aa18.19■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 MCM9Q9NXL9 1143 aa18.19■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 CLRN2A0PK11 232 aa18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 FGAP02671 866 aa18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 EPS15P42566 896 aa18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 FLT1P17948 1338 aa18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa18.17■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 SHTN1A0MZ66 631 aa18.17■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 MINDY4BA8MYZ0 360 aa18.17■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 WNT10BO00744 389 aa18.17■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 HLA-DOAP06340 250 aa18.17■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 HSPA4P34932 840 aa18.17■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 TNFAIP1Q13829 316 aa18.17■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 SPDYE2Q495Y8 402 aa18.17■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 CREB3L3Q68CJ9 461 aa18.17■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 SLC27A2O14975 620 aa18.16■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 ENTPD3O75355 529 aa18.16■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 CACNB3P54284 484 aa18.16■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 KRT32Q14532 448 aa18.16■□□□□ 0.5
FCHO1-235ENST00000601247 NBPF9Q3BBW0 867 aa18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.1 ms