RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597512.1

FCHO1-221, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FCHO1, Length 2,934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-221ENST00000597512 TXNRD3Q86VQ6 643 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 TMEM87BQ96K49 555 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 UBE2HP62256 183 aa16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 KRT85P78386 507 aa16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 DDR1Q08345 913 aa16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 KRT23Q9C075 422 aa16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 MYH15Q9Y2K3 1946 aa16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 MFSD6Q6ZSS7 791 aa16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 STAG1Q8WVM7 1258 aa16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 HPS5Q9UPZ3 1129 aa16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 APBA3O96018 575 aa16.18■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 NKX2-3Q8TAU0 364 aa16.18■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF384Q8TF68 577 aa16.18■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 MECOMQ03112 1051 aa16.18■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF827Q17R98 1081 aa16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 SDR42E1Q8WUS8 393 aa16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 INCENPQ9NQS7 918 aa16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 RESTQ13127 1097 aa16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 AKT1S1Q96B36 256 aa16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 KDM4AO75164 1064 aa16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 PPARAQ07869 468 aa16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF804AQ7Z570 1209 aa16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 SLC51AQ86UW1 340 aa16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 ZSWIM5Q9P217 1185 aa16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 TACC3Q9Y6A5 838 aa16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 BBOX1O75936 387 aa16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 GPSM2P81274 684 aa16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 TMEM67Q5HYA8 995 aa16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 FAM173BQ6P4H8 233 aa16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 BRIP1Q9BX63 1249 aa16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 ANAPC4Q9UJX5 808 aa16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 NRXN2Q9P2S2 1712 aa16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 CPLX1O14810 134 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 RXRBP28702 533 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 PRDX5P30044 214 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 LY9Q9HBG7 655 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 ELP1O95163 1332 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 IGSF3O75054 1194 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 SGMS1Q86VZ5 419 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 WDR66Q8TBY9 1149 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 CRAMP1Q96RY5 1269 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 LRRC37AA6NMS7 1700 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 FDPSP14324 419 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 ATP2B4P23634 1241 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 LIFRP42702 1097 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 GIMAP6Q6P9H5 292 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 APOA5Q6Q788 366 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 NFXL1Q6ZNB6 911 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 NLGN1Q8N2Q7 840 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 TOMM22Q9NS69 142 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-221ENST00000597512 SYCE3A1L190 88 aa16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 MINDY4BA8MYZ0 360 aa16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 FOSBP53539 338 aa16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 LRSAM1Q6UWE0 723 aa16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 LAMB1P07942 1786 aa16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 TTC6Q86TZ1 520 aa16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 FLAD1Q8NFF5 587 aa16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 MTA3Q9BTC8 594 aa16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 GGA1Q9UJY5 639 aa16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 JAG2Q9Y219 1238 aa16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 PPFIA3O75145 1194 aa16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 UFL1O94874 794 aa16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 SART3Q15020 963 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 PANK2Q9BZ23 570 aa16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 SENP2Q9HC62 589 aa16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 ZBTB43O43298 467 aa16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 SPATA32Q96LK8 384 aa16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 DUOX1Q9NRD9 1551 aa16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-221ENST00000597512 CCDC69A6NI79 296 aa16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms