RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590924.5

VAT1-208, Transcript of vesicle amine transport 1, humanhuman

TSL 3

Gene VAT1, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1-208ENST00000590924 MAP3K9P80192 1104 aa22.24■■□□□ 1.15
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VAT1-208ENST00000590924 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
VAT1-208ENST00000590924 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.23■■□□□ 1.15
VAT1-208ENST00000590924 COPRSQ9NQ92 184 aa22.23■■□□□ 1.15
VAT1-208ENST00000590924 CSADQ9Y600 493 aa22.23■■□□□ 1.15
VAT1-208ENST00000590924 ZBTB22O15209 634 aa22.22■■□□□ 1.15
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VAT1-208ENST00000590924 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.22■■□□□ 1.15
VAT1-208ENST00000590924 HOOK2Q96ED9 719 aa22.22■■□□□ 1.15
VAT1-208ENST00000590924 PTPN18Q99952 460 aa22.22■■□□□ 1.15
VAT1-208ENST00000590924 HTTP42858 3142 aa22.22■■□□□ 1.15
VAT1-208ENST00000590924 GNAI2P04899 355 aa22.21■■□□□ 1.15
VAT1-208ENST00000590924 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.21■■□□□ 1.15
VAT1-208ENST00000590924 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
VAT1-208ENST00000590924 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
VAT1-208ENST00000590924 COG6Q9Y2V7 657 aa22.21■■□□□ 1.15
VAT1-208ENST00000590924 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
VAT1-208ENST00000590924 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.21■■□□□ 1.15
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VAT1-208ENST00000590924 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.2■■□□□ 1.14
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VAT1-208ENST00000590924 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 PRDX5P30044 214 aa22.19■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 PHKA1P46020 1223 aa22.19■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 GTF2A2P52657 109 aa22.19■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 DCAF15Q66K64 600 aa22.19■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.19■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 ERO1AQ96HE7 468 aa22.19■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.19■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 TRIM17Q9Y577 477 aa22.19■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
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VAT1-208ENST00000590924 MTX1Q13505 466 aa22.18■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.18■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 OTUD5Q96G74 571 aa22.18■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 WRNIP1Q96S55 665 aa22.18■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.18■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.17■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.17■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 CCL15Q16663 113 aa22.17■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 ERO1BQ86YB8 467 aa22.17■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 FAM151AQ8WW52 585 aa22.17■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 CENPFP49454 3210 aa22.17■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 PTPRFP10586 1907 aa22.16■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.16■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 SP3Q02447 781 aa22.16■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 CCDC102BQ68D86 513 aa22.16■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.16■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.16■■□□□ 1.14
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VAT1-208ENST00000590924 ADORA1P30542 326 aa22.15■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
VAT1-208ENST00000590924 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.15■■□□□ 1.14
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VAT1-208ENST00000590924 AAMPQ13685 434 aa22.13■■□□□ 1.13
VAT1-208ENST00000590924 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.13■■□□□ 1.13
VAT1-208ENST00000590924 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.13■■□□□ 1.13
VAT1-208ENST00000590924 A0A1B0GUL7 405 aa22.12■■□□□ 1.13
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VAT1-208ENST00000590924 CETPP11597 493 aa22.12■■□□□ 1.13
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VAT1-208ENST00000590924 TCP10Q12799 353 aa22.12■■□□□ 1.13
VAT1-208ENST00000590924 SNAPC2Q13487 334 aa22.12■■□□□ 1.13
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VAT1-208ENST00000590924 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.12■■□□□ 1.13
VAT1-208ENST00000590924 EFCC1Q9HA90 598 aa22.12■■□□□ 1.13
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VAT1-208ENST00000590924 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.12■■□□□ 1.13
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VAT1-208ENST00000590924 GAKO14976 1311 aa22.11■■□□□ 1.13
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VAT1-208ENST00000590924 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.11■■□□□ 1.13
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VAT1-208ENST00000590924 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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VAT1-208ENST00000590924 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.09■■□□□ 1.13
VAT1-208ENST00000590924 BTBD19C9JJ37 291 aa22.09■■□□□ 1.13
VAT1-208ENST00000590924 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
VAT1-208ENST00000590924 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
VAT1-208ENST00000590924 IDI2Q9BXS1 227 aa22.09■■□□□ 1.13
VAT1-208ENST00000590924 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.09■■□□□ 1.13
VAT1-208ENST00000590924 ARHGEF6Q15052 776 aa22.08■■□□□ 1.13
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