RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	7.27	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	IGHA1	P01876	353 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	CPB1	P15086	417 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	TCEAL1	Q15170	157 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	CEP135	Q66GS9	1140 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	STK35	Q8TDR2	534 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	TTC9	Q92623	222 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		7.26	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM229A	H3BQW9	127 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	KLF4	O43474	513 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	GHRH	P01286	108 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	GRIK5	Q16478	980 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	CD163	Q86VB7	1156 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		7.25	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	MSTN	O14793	375 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	MCM4	P33991	863 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	NFE2L2	Q16236	605 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	ILDR2	Q71H61	639 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	NUDT8	Q8WV74	236 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	SHD	Q96IW2	340 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		7.24	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	LMNB1	P20700	586 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	BMP6	P22004	513 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	PCDH1	Q08174	1060 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	RAB33A	Q14088	237 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	NBPF4	Q96M43	638 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	CBX8	Q9HC52	389 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	SNTG2	Q9NY99	539 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		7.23	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	7.22	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	SULF2	Q8IWU5	870 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	BSND	Q8WZ55	320 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		7.22	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM221A	A4D161	298 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	LILRB5	O75023	590 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	CDC25B	P30305	580 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	RASA3	Q14644	834 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	GK5	Q6ZS86	529 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	RBSN	Q9H1K0	784 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	ST7	Q9NRC1	585 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	SOX13	Q9UN79	622 aa		7.21	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	B3GALT4	O96024	378 aa		7.2	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	NME2	P22392	152 aa		7.2	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	BAG6	P46379	1132 aa		7.2	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	XP32	Q5T750	250 aa		7.2	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	LRRC3	Q9BY71	257 aa		7.2	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		7.2	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	GRIN3B	O60391	1043 aa		7.19	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	CILP	O75339	1184 aa		7.19	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	CDK8	P49336	464 aa		7.19	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
ATP9B-223	ENST00000590608	CLC	Q05315	142 aa		7.19	□□□□□ -1.26

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