RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 RGPD1P0DJD0 1748 aa10.04□□□□□ -0.8
EFTUD2-216ENST00000590105 RGPD2P0DJD1 1756 aa10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-216ENST00000590105 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-216ENST00000590105 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-216ENST00000590105 NR5A1Q13285 461 aa10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-216ENST00000590105 AAMPQ13685 434 aa10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-216ENST00000590105 SCARF1Q14162 830 aa10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-216ENST00000590105 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-216ENST00000590105 NPAS3Q8IXF0 933 aa10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF654Q8IZM8 581 aa10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-216ENST00000590105 FBF1Q8TES7 1133 aa10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-216ENST00000590105 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-216ENST00000590105 CFAP53Q96M91 514 aa10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-216ENST00000590105 PEAK1Q9H792 1746 aa10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC87Q9NVE4 849 aa10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-216ENST00000590105 NUDCQ9Y266 331 aa10.03□□□□□ -0.8
EFTUD2-216ENST00000590105 PHKG2P15735 406 aa10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP2R1AP30153 589 aa10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC27A3Q5K4L6 730 aa10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 CYLDQ9NQC7 956 aa10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 STK32BQ9NY57 414 aa10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 SBF2Q86WG5 1849 aa10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 MEGF6O75095 1541 aa10.02□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 ERVV-2B6SEH9 535 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 GPR182O15218 404 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 FSHRP23945 695 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 USP5P45974 858 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC15A2Q16348 729 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 PIGBQ92521 554 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 CRELD1Q96HD1 420 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 WWC3Q9ULE0 1092 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa10.01□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 LRRC37A3O60309 1634 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM229AB2RXF0 380 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 HMOX1P09601 288 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 RALBP1Q15311 655 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 C1orf141Q5JVX7 400 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 DCAF5Q96JK2 942 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 BRINP2Q9C0B6 783 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 SAP130Q9H0E3 1048 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 AK5Q9Y6K8 562 aa10□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 NCAPD2Q15021 1401 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 TNNI2P48788 182 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 MEIOBQ8N635 442 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 LRRC4BQ9NT99 713 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 RNF19AQ9NV58 838 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 TMOD3Q9NYL9 352 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa9.99□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 WNK3Q9BYP7 1800 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 CLSTN1O94985 981 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 CABP4P57796 275 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 AKAP4Q5JQC9 854 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 SPACA7Q96KW9 195 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 OSBPL2Q9H1P3 480 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 PIF1Q9H611 641 aa9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 BMP2P12643 396 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 EPHA4P54764 986 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 COX20Q5RI15 118 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC4A9Q96Q91 983 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 NIF3L1Q9GZT8 377 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 DNMT3LQ9UJW3 386 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 KDRP35968 1356 aa9.97□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
EFTUD2-216ENST00000590105 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 TNFRSF10BO14763 440 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 MARCH6O60337 910 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 MAN1A2O60476 641 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 KCNQ4P56696 695 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 TNS4Q8IZW8 715 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 GJD3Q8N144 294 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 MYO19Q96H55 970 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 SPON1Q9HCB6 807 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 ATG3Q9NT62 314 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 ASAP1Q9ULH1 1129 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa9.96□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 STK10O94804 968 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 VSIG8P0DPA2 414 aa9.95□□□□□ -0.82
EFTUD2-216ENST00000590105 HSD3B2P26439 372 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms