RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589969.1

NFIC-209, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

TSL 3

Gene NFIC, Length 614 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-209ENST00000589969 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.57■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.57■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 ADORA1P30542 326 aa25.57■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 TIMM10P62072 90 aa25.57■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.57■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.57■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 ERO1BQ86YB8 467 aa25.57■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 A0A1B0GUL7 405 aa25.56■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 TFCP2Q12800 502 aa25.56■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 CRHR2Q13324 411 aa25.56■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 SLF2Q8IX21 1173 aa25.56■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.56■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 OTUD5Q96G74 571 aa25.56■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 ERO1AQ96HE7 468 aa25.56■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.56■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 OTOFQ9HC10 1997 aa25.56■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 MIER1Q8N108 512 aa25.55■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.55■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 XAGE2Q96GT9 111 aa25.55■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 USP40Q9NVE5 1235 aa25.55■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.54■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 RASGRF1Q13972 1273 aa25.54■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 CCL15Q16663 113 aa25.54■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.54■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.54■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 SOX10P56693 466 aa25.53■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.53■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 CETPP11597 493 aa25.52■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 TCP10Q12799 353 aa25.52■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.52■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.52■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa25.52■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 ABCF2Q9UG63 623 aa25.52■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 TNNQ9UQP3 1299 aa25.52■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 TRIM17Q9Y577 477 aa25.52■■□□□ 1.68
NFIC-209ENST00000589969 SP3Q02447 781 aa25.51■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 NFIAQ12857 509 aa25.51■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 PPIL2Q13356 520 aa25.51■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 SNAPC2Q13487 334 aa25.51■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 GORABQ5T7V8 394 aa25.51■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.51■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.51■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 FAM198AQ9UFP1 575 aa25.51■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 GAKO14976 1311 aa25.51■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 PPATQ06203 517 aa25.5■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 IDI2Q9BXS1 227 aa25.5■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.5■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.49■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 ENTPD3O75355 529 aa25.49■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 ARHGEF6Q15052 776 aa25.49■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 IRF6O14896 467 aa25.48■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.48■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 EFCC1Q9HA90 598 aa25.48■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.47■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.47■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 INPP5BP32019 993 aa25.46■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 RGS3P49796 1198 aa25.46■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 SPATA5Q8NB90 893 aa25.46■■□□□ 1.67
NFIC-209ENST00000589969 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa25.45■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.45■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 GSTO1P78417 241 aa25.45■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 POLA2Q14181 598 aa25.45■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 GPR108Q9NPR9 543 aa25.45■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.45■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 PTPN22Q9Y2R2 807 aa25.45■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 BTBD19C9JJ37 291 aa25.44■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 LDHCP07864 332 aa25.44■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 BTDP43251 543 aa25.44■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 ATP8B2P98198 1209 aa25.44■■□□□ 1.66
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NFIC-209ENST00000589969 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.44■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 SSH3Q8TE77 659 aa25.44■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa25.43■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.43■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.43■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.42■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 TLR2O60603 784 aa25.42■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.42■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 MYH2Q9UKX2 1941 aa25.41■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 MAP3K10Q02779 954 aa25.41■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
NFIC-209ENST00000589969 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.41■■□□□ 1.66
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