RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589853.3

GTF3C2-AS1-207, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KCNK4Q9NYG8 393 aa8.71□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa8.71□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GLI2P10070 1586 aa8.7□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa8.7□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.7□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.7□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ADAM11O75078 769 aa8.69□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SELPP16109 830 aa8.69□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ITGAEP38570 1179 aa8.69□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RBM25P49756 843 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RASSF7Q02833 373 aa8.69□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CRELD1Q96HD1 420 aa8.69□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DCAF5Q96JK2 942 aa8.69□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.69□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GOLGA3Q08378 1498 aa8.69□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KRBA1A5PL33 1030 aa8.68□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GSK3AP49840 483 aa8.68□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KCNMA1Q12791 1236 aa8.68□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.68□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa8.68□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 APBA3O96018 575 aa8.67□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.67□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DCAF11Q8TEB1 546 aa8.67□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BACH2Q9BYV9 841 aa8.67□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CEP44Q9C0F1 390 aa8.67□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 WDR7Q9Y4E6 1490 aa8.66□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USP31Q70CQ4 1352 aa8.66□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ENC1O14682 589 aa8.66□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PAGE1O75459 146 aa8.66□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 WISP1O95388 367 aa8.66□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CELA3AP09093 270 aa8.66□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.66□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa8.66□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.66□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USP26Q9BXU7 913 aa8.66□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USP21Q9UK80 565 aa8.66□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ECEL1O95672 775 aa8.65□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CYP11A1P05108 521 aa8.65□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.65□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM87AQ8NBN3 555 aa8.65□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.65□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GDF11O95390 407 aa8.64□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MAOBP27338 520 aa8.64□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 POU4F3Q15319 338 aa8.64□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ACAD11Q709F0 780 aa8.64□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SV2BQ7L1I2 683 aa8.64□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 STK35Q8TDR2 534 aa8.64□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NACC1Q96RE7 527 aa8.64□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NRSN2Q9GZP1 204 aa8.64□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C9orf172C9J069 976 aa8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ALX3O95076 343 aa8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DLGAP3O95886 979 aa8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RECKO95980 971 aa8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CHRNA4P43681 627 aa8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ST13P50502 369 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 AP3B2Q13367 1082 aa8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SULF2Q8IWU5 870 aa8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CORO1BQ9BR76 489 aa8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.62□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CTSBP07858 339 aa8.62□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 VAMP1P23763 118 aa8.62□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MAP3K11Q16584 847 aa8.62□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.62□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CD163Q86VB7 1156 aa8.62□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.62□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KDM6BO15054 1643 aa8.62□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.61□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BMP6P22004 513 aa8.61□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NME2P22392 152 aa8.61□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ARNTP27540 789 aa8.61□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CBX8Q9HC52 389 aa8.61□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ABCA9Q8IUA7 1624 aa8.61□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.6□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 F6X3S4 739 aa8.6□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 F8W735 103 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms