RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589054.5

NEDD4L-225, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene NEDD4L, Length 1,033 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-225ENST00000589054 TCP10Q12799 353 aa26.58■■□□□ 1.85
NEDD4L-225ENST00000589054 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa26.58■■□□□ 1.85
NEDD4L-225ENST00000589054 TMOD2Q9NZR1 351 aa26.58■■□□□ 1.85
NEDD4L-225ENST00000589054 IRF6O14896 467 aa26.57■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 BCAR3O75815 825 aa26.57■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 GTF2A2P52657 109 aa26.57■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 SP3Q02447 781 aa26.57■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 CCDC102BQ68D86 513 aa26.57■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 FAM151AQ8WW52 585 aa26.57■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.57■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 PTPN22Q9Y2R2 807 aa26.57■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa26.56■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 CENPFP49454 3210 aa26.56■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 SALL1Q9NSC2 1324 aa26.56■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 ERO1BQ86YB8 467 aa26.55■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 ERO1AQ96HE7 468 aa26.55■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 POTEFA5A3E0 1075 aa26.54■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 BTBD19C9JJ37 291 aa26.54■■□□□ 1.84
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NEDD4L-225ENST00000589054 TRIM27P14373 513 aa26.54■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 TFCP2Q12800 502 aa26.54■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 RASGRF1Q13972 1273 aa26.54■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 USP40Q9NVE5 1235 aa26.54■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 ZNF112Q9UJU3 913 aa26.54■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 DENND2AQ9ULE3 1009 aa26.54■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 MTX1Q13505 466 aa26.53■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 EFCC1Q9HA90 598 aa26.53■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
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NEDD4L-225ENST00000589054 SRGAP3O43295 1099 aa26.52■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 SLC34A2O95436 690 aa26.52■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 ZNF341Q9BYN7 854 aa26.52■■□□□ 1.84
NEDD4L-225ENST00000589054 PPIL2Q13356 520 aa26.51■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa26.51■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 ZNF384Q8TF68 577 aa26.51■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 XAGE2Q96GT9 111 aa26.51■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa26.51■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 A0A1B0GUL7 405 aa26.5■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 SEMA3EO15041 775 aa26.5■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 DCAF15Q66K64 600 aa26.5■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa26.5■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 BRCA2P51587 3418 aa26.5■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 ATRNL1Q5VV63 1379 aa26.49■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 GAKO14976 1311 aa26.49■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.49■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 GNAI3P08754 354 aa26.49■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 CETPP11597 493 aa26.49■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 MOGSQ13724 837 aa26.49■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.49■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 MYH13Q9UKX3 1938 aa26.49■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 SNAPC2Q13487 334 aa26.48■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 PI16Q6UXB8 463 aa26.48■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 HOOK2Q96ED9 719 aa26.48■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.48■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 RFX7Q2KHR2 1363 aa26.47■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 RGS3P49796 1198 aa26.47■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 PPATQ06203 517 aa26.47■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.47■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 ARMC5Q96C12 935 aa26.47■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 PHF20L1A8MW92 1017 aa26.46■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 TLR2O60603 784 aa26.46■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 CTGFP29279 349 aa26.46■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 IDI2Q9BXS1 227 aa26.46■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 ABCF2Q9UG63 623 aa26.46■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 KCNH4Q9UQ05 1017 aa26.46■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa26.46■■□□□ 1.83
NEDD4L-225ENST00000589054 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa26.44■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 HMG20BQ9P0W2 317 aa26.44■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 MECOMQ03112 1051 aa26.43■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 C17orf99Q6UX52 265 aa26.43■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa26.43■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.43■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 NEUROD6Q96NK8 337 aa26.43■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 ADGRA2Q96PE1 1338 aa26.42■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 GNAI2P04899 355 aa26.42■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 EN2P19622 333 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 BTDP43251 543 aa26.42■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 RHBDL3P58872 404 aa26.42■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 ZNF333Q96JL9 665 aa26.42■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 CPA4Q9UI42 421 aa26.42■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 AKAP2Q9Y2D5 859 aa26.42■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 ENTPD3O75355 529 aa26.41■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
NEDD4L-225ENST00000589054 MAP3K10Q02779 954 aa26.41■■□□□ 1.82
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