RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 B4E1Z4 1266 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 VGLL3A8MV65 326 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 IL2RBP14784 551 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 A2MP01023 1474 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 VPS16Q9H269 839 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 LETM2Q2VYF4 491 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 RILPL1Q5EBL4 403 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 TNNI3KQ59H18 835 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 SAMD15Q9P1V8 674 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 KCNH3Q9ULD8 1083 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 JAG2Q9Y219 1238 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC65Q8IXS2 484 aa23.95■■□□□ 1.43
PTPRM-211ENST00000580170 HOXC9P31274 260 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 DEXIO95424 95 aa23.95■■□□□ 1.42
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PTPRM-211ENST00000580170 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 DCAF5Q96JK2 942 aa23.95■■□□□ 1.42
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PTPRM-211ENST00000580170 SEL1L2Q5TEA6 688 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 CYP26C1Q6V0L0 522 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 OGFOD1Q8N543 542 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 CBX8Q9HC52 389 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 RPL13P26373 211 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF75DP51815 510 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 TRAF5O00463 557 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 FANCCQ00597 558 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 PDE4DQ08499 809 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 CALCOCO2Q13137 446 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.94■■□□□ 1.42
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PTPRM-211ENST00000580170 AOX1Q06278 1338 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
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PTPRM-211ENST00000580170 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
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PTPRM-211ENST00000580170 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 FAM227BQ96M60 508 aa23.92■■□□□ 1.42
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PTPRM-211ENST00000580170 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa23.92■■□□□ 1.42
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PTPRM-211ENST00000580170 DDB1Q16531 1140 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 ARMT1Q9H993 441 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 ATP10BO94823 1461 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 SETDB1Q15047 1291 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 STIM2Q9P246 746 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
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PTPRM-211ENST00000580170 EYA2O00167 538 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 RIMBP2O15034 1052 aa23.9■■□□□ 1.42
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PTPRM-211ENST00000580170 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 JAKMIP2Q96AA8 810 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 NLRP12P59046 1061 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 MSANTD4Q8NCY6 345 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 FMNL3Q8IVF7 1028 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 CUTAO60888 179 aa23.89■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF445P59923 1031 aa23.89■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa23.89■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.89■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 PPFIBP2Q8ND30 876 aa23.89■■□□□ 1.42
PTPRM-211ENST00000580170 SGSM2O43147 1006 aa23.89■■□□□ 1.42
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