RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578995.5

SMARCE1-215, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, human

TSL 2

Gene SMARCE1, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCE1-215	ENST00000578995	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	PHKA2	P46019	1235 aa		5	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	ITPK1	Q13572	414 aa		5	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	AMHR2	Q16671	573 aa		5	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		5	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		5	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	WWC1	Q8IX03	1113 aa		5	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		5	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	KLF15	Q9UIH9	416 aa		5	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	CHL1	O00533	1208 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	ALAS2	P22557	587 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	MSX1	P28360	303 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	RIPK4	P57078	832 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	ERVK-9	P63128	1117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	SLC39A6	Q13433	755 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	TXNRD1	Q16881	649 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	TP53INP1	Q96A56	240 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	IL16	Q14005	1332 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	TAF1	P21675	1872 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	KCNQ4	P56696	695 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	SIK1	P57059	783 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	CABP4	P57796	275 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	ADGRE1	Q14246	886 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	GRIK4	Q16099	956 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	KRT24	Q2M2I5	525 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	ZNF790	Q6PG37	636 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	SPEF2	Q9C093	1822 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	JAG1	P78504	1218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	MBTPS1	Q14703	1052 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	NR6A1	Q15406	480 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	PNMA1	Q8ND90	353 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	IFT57	Q9NWB7	429 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	COL4A1	P02462	1669 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SMARCE1-215	ENST00000578995	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	CENPC	Q03188	943 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	TEF	Q10587	303 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	NEUROD2	Q15784	382 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	ELOA3	Q8NG57	546 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	SBF1	O95248	1867 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	SLFN5	Q08AF3	891 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCE1-215	ENST00000578995	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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