RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577315.5

MKS1-205, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 3

Gene MKS1, Length 495 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-205ENST00000577315 SLF2Q8IX21 1173 aa18.49■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 FAM151AQ8WW52 585 aa18.49■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 A0A1B0GUL7 405 aa18.48■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 MIER1Q8N108 512 aa18.48■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 ZNF341Q9BYN7 854 aa18.48■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 TIMM10P62072 90 aa18.47■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 DIXDC1Q155Q3 683 aa18.47■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa18.47■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 ERO1BQ86YB8 467 aa18.47■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 CLUAP1Q96AJ1 413 aa18.47■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 MS4A4AQ96JQ5 239 aa18.47■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 WRNIP1Q96S55 665 aa18.47■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa18.47■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 HPS5Q9UPZ3 1129 aa18.47■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 SPDYE5A6NIY4 337 aa18.46■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 ADORA1P30542 326 aa18.46■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 TFCP2Q12800 502 aa18.46■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 XAGE2Q96GT9 111 aa18.46■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 ERO1AQ96HE7 468 aa18.46■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 DOCK2Q92608 1830 aa18.46■□□□□ 0.55
MKS1-205ENST00000577315 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa18.45■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 CRHR2Q13324 411 aa18.45■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 CCL15Q16663 113 aa18.45■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 TMEM57Q8N5G2 664 aa18.45■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 OTUD5Q96G74 571 aa18.45■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 NEUROD6Q96NK8 337 aa18.45■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 PTPN18Q99952 460 aa18.45■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 USP40Q9NVE5 1235 aa18.45■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 RASGRF1Q13972 1273 aa18.44■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 ARHGEF6Q15052 776 aa18.44■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 GORABQ5T7V8 394 aa18.44■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa18.44■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 ABCF2Q9UG63 623 aa18.44■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 TNNQ9UQP3 1299 aa18.44■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa18.44■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 GAKO14976 1311 aa18.44■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 ENTPD3O75355 529 aa18.43■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 CETPP11597 493 aa18.43■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 SP3Q02447 781 aa18.43■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 PPATQ06203 517 aa18.43■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 PPIL2Q13356 520 aa18.43■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 ERICH6Q7L0X2 663 aa18.43■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 BRI3BPQ8WY22 251 aa18.43■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 IDI2Q9BXS1 227 aa18.43■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 TRIM17Q9Y577 477 aa18.43■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa18.43■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa18.42■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 TCP10Q12799 353 aa18.42■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 SNAPC2Q13487 334 aa18.42■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 MIGA2Q7L4E1 593 aa18.42■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa18.42■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 ZNF112Q9UJU3 913 aa18.42■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 LDHCP07864 332 aa18.41■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 SOX10P56693 466 aa18.41■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 ATP8B2P98198 1209 aa18.41■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 NFIAQ12857 509 aa18.41■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 POLA2Q14181 598 aa18.41■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 OTOP1Q7RTM1 612 aa18.41■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 GPR108Q9NPR9 543 aa18.41■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 FAM198AQ9UFP1 575 aa18.41■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 ZBED9Q6R2W3 1325 aa18.41■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 IRF6O14896 467 aa18.4■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa18.4■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 GSTO1P78417 241 aa18.4■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa18.4■□□□□ 0.54
MKS1-205ENST00000577315 IGSF3O75054 1194 aa18.39■□□□□ 0.53
MKS1-205ENST00000577315 INPP5BP32019 993 aa18.39■□□□□ 0.53
MKS1-205ENST00000577315 RGS3P49796 1198 aa18.39■□□□□ 0.53
MKS1-205ENST00000577315 FAM43AQ8N2R8 423 aa18.39■□□□□ 0.53
MKS1-205ENST00000577315 SPATA5Q8NB90 893 aa18.39■□□□□ 0.53
MKS1-205ENST00000577315 SSH3Q8TE77 659 aa18.39■□□□□ 0.53
MKS1-205ENST00000577315 EFCC1Q9HA90 598 aa18.39■□□□□ 0.53
MKS1-205ENST00000577315 HMG20BQ9P0W2 317 aa18.39■□□□□ 0.53
MKS1-205ENST00000577315 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa18.38■□□□□ 0.53
MKS1-205ENST00000577315 NPM3O75607 178 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
MKS1-205ENST00000577315 BTDP43251 543 aa18.38■□□□□ 0.53
MKS1-205ENST00000577315 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
MKS1-205ENST00000577315 ITPRIPQ8IWB1 547 aa18.38■□□□□ 0.53
MKS1-205ENST00000577315 CD99L2Q8TCZ2 262 aa18.38■□□□□ 0.53
MKS1-205ENST00000577315 PTPN22Q9Y2R2 807 aa18.38■□□□□ 0.53
MKS1-205ENST00000577315 MECOMQ03112 1051 aa18.37■□□□□ 0.53
MKS1-205ENST00000577315 CCDC158Q5M9N0 1113 aa18.37■□□□□ 0.53
MKS1-205ENST00000577315 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
MKS1-205ENST00000577315 KCNH4Q9UQ05 1017 aa18.37■□□□□ 0.53
MKS1-205ENST00000577315 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
MKS1-205ENST00000577315 RFX7Q2KHR2 1363 aa18.37■□□□□ 0.53
MKS1-205ENST00000577315 DOCK1Q14185 1865 aa18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms