RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 ELP1O95163 1332 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 NPR1P16066 1061 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 GRAPQ13588 217 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 NAPBQ9H115 298 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 H0YIN7 160 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 CHST3Q7LGC8 479 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 MASTLQ96GX5 879 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 MYH15Q9Y2K3 1946 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC183Q5T5S1 534 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 MAST2Q6P0Q8 1798 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS3-204ENST00000575194 CHRNA5P30532 468 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 GYG1P46976 350 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 NASPP49321 788 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 DDX11Q96FC9 970 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 PANK2Q9BZ23 570 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 NBPF3Q9H094 633 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 ANTXR2P58335 489 aa21.94■■□□□ 1.1
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SPNS3-204ENST00000575194 STYK1Q6J9G0 422 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 FERMT3Q86UX7 667 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 TMEM87BQ96K49 555 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 ARMT1Q9H993 441 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 SYCE3A1L190 88 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 ZBTB22O15209 634 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 DTNBO60941 627 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 BBOX1O75936 387 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 CTDNEP1O95476 244 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 KCNA3P22001 575 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 ALDH1B1P30837 517 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 RESTQ13127 1097 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 FBXO33Q7Z6M2 555 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 KRT23Q9C075 422 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 RAI14Q9P0K7 980 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 CYP7A1P22680 504 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 TDO2P48775 406 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 TGFB2P61812 414 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 LCORLQ8N3X6 602 aa21.92■■□□□ 1.1
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SPNS3-204ENST00000575194 CACNA1SQ13698 1873 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 RGS22Q8NE09 1264 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
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SPNS3-204ENST00000575194 ABCF2Q9UG63 623 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 IGSF3O75054 1194 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 DPEP1P16444 411 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 ATL3Q6DD88 541 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 CFAP45Q9UL16 551 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 CPLX1O14810 134 aa21.89■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 CDKL5O76039 1030 aa21.89■■□□□ 1.1
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SPNS3-204ENST00000575194 CCDC173Q0VFZ6 552 aa21.89■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.89■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 TMC4Q7Z404 712 aa21.89■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.89■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 CNKSR1Q969H4 720 aa21.89■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 SPATA32Q96LK8 384 aa21.89■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 NEDD4P46934 1319 aa21.89■■□□□ 1.1
SPNS3-204ENST00000575194 B4E1Z4 1266 aa21.89■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.89■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 MTA3Q9BTC8 594 aa21.89■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 SLX4Q8IY92 1834 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 TTC6Q86TZ1 520 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 SLC51AQ86UW1 340 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.87■■□□□ 1.09
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