RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 C8orf58Q8NAV2 365 aa9.48□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 TRIM7Q9C029 511 aa9.48□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 STRN3Q13033 797 aa9.48□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 UBASH3AP57075 661 aa9.48□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.48□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 CEP112Q8N8E3 955 aa9.48□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 MSANTD4Q8NCY6 345 aa9.48□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 YIPF2Q9BWQ6 316 aa9.48□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 H0YIN7 160 aa9.48□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 KCNH5Q8NCM2 988 aa9.48□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 MCM9Q9NXL9 1143 aa9.48□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa9.48□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 AZI2Q9H6S1 392 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 HYPKQ9NX55 129 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 STX10O60499 249 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 CCDC172P0C7W6 258 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 MCM7P33993 719 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 PTPRCP08575 1304 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 ASIC1P78348 528 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 WDR44Q5JSH3 913 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 KIAA1524Q8TCG1 905 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 PPP1R16BQ96T49 567 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 TRPC6Q9Y210 931 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 CSADQ9Y600 493 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 ZBBXA8MT70 800 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 H7C1D1 291 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 UBE2HP62256 183 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 SWAP70Q9UH65 585 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 ADGRL1O94910 1474 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 ZNF165P49910 485 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 GNG11P61952 73 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 APOBRQ0VD83 1088 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 SLC12A1Q13621 1099 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 MAP9Q49MG5 647 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 IFT140Q96RY7 1462 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa9.47□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 ANKRD35Q8N283 1001 aa9.46□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 UBN1Q9NPG3 1134 aa9.46□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 CALML3P27482 149 aa9.46□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 IARSP41252 1262 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 KIAA1841Q6NSI8 718 aa9.46□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.46□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.46□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 UFL1O94874 794 aa9.46□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 BLVRAP53004 296 aa9.46□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 ANKRD24Q8TF21 1146 aa9.46□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 ZNF653Q96CK0 615 aa9.46□□□□□ -0.89
PDPR-210ENST00000568530 STX17P56962 302 aa9.46□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 ITIH3Q06033 890 aa9.46□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 WTAPQ15007 396 aa9.46□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 C8orf34Q49A92 452 aa9.46□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 MIPOL1Q8TD10 442 aa9.46□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 CCDC77Q9BR77 488 aa9.46□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 POGZQ7Z3K3 1410 aa9.46□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 FAM114A1Q8IWE2 563 aa9.46□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 CCDC110Q8TBZ0 833 aa9.46□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 SEPT8Q92599 483 aa9.46□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 SYKP43405 635 aa9.46□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 MCM6Q14566 821 aa9.46□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 ALG1Q9BT22 464 aa9.46□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa9.45□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 MAPKBP1O60336 1514 aa9.45□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 NIM1KQ8IY84 436 aa9.45□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 MMS19Q96T76 1030 aa9.45□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 NSMFQ6X4W1 530 aa9.45□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 SZRD1Q7Z422 152 aa9.45□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 BRF1Q92994 677 aa9.45□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 DHX58Q96C10 678 aa9.45□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 SLC52A1Q9NWF4 448 aa9.45□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 ACEP12821 1306 aa9.45□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 HSF2BPO75031 334 aa9.45□□□□□ -0.9
PDPR-210ENST00000568530 RLBP1P12271 317 aa9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms