RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567377.5

COMMD4-218, Transcript of COMM domain containing 4, humanhuman

TSL 3

Gene COMMD4, Length 461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD4-218ENST00000567377 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
COMMD4-218ENST00000567377 FAM151AQ8WW52 585 aa22.34■■□□□ 1.17
COMMD4-218ENST00000567377 WNK4Q96J92 1243 aa22.34■■□□□ 1.17
COMMD4-218ENST00000567377 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.34■■□□□ 1.17
COMMD4-218ENST00000567377 ABCF2Q9UG63 623 aa22.34■■□□□ 1.17
COMMD4-218ENST00000567377 MAP3K9P80192 1104 aa22.33■■□□□ 1.17
COMMD4-218ENST00000567377 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.33■■□□□ 1.17
COMMD4-218ENST00000567377 TNNI3KQ59H18 835 aa22.33■■□□□ 1.17
COMMD4-218ENST00000567377 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
COMMD4-218ENST00000567377 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.33■■□□□ 1.17
COMMD4-218ENST00000567377 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.33■■□□□ 1.17
COMMD4-218ENST00000567377 CEP85Q6P2H3 762 aa22.33■■□□□ 1.17
COMMD4-218ENST00000567377 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.33■■□□□ 1.17
COMMD4-218ENST00000567377 SPATA5Q8NB90 893 aa22.33■■□□□ 1.17
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COMMD4-218ENST00000567377 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.33■■□□□ 1.17
COMMD4-218ENST00000567377 GAKO14976 1311 aa22.32■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 LDHCP07864 332 aa22.32■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 CACNB3P54284 484 aa22.32■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 GSTO1P78417 241 aa22.32■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.32■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.32■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 USP40Q9NVE5 1235 aa22.32■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.32■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 CSADQ9Y600 493 aa22.32■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.32■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.31■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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COMMD4-218ENST00000567377 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 PDE3AQ14432 1141 aa22.3■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 IDI2Q9BXS1 227 aa22.3■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 ENTPD3O75355 529 aa22.29■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.29■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.28■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.28■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.28■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.27■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.27■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 MCAMP43121 646 aa22.27■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 MECOMQ03112 1051 aa22.27■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 VGLL4Q14135 290 aa22.27■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 IFNL1Q8IU54 200 aa22.27■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 ABHD8Q96I13 439 aa22.27■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 ELP3Q9H9T3 547 aa22.27■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.27■■□□□ 1.16
COMMD4-218ENST00000567377 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.27■■□□□ 1.16
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COMMD4-218ENST00000567377 WRNIP1Q96S55 665 aa22.26■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.26■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.26■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 COG6Q9Y2V7 657 aa22.26■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 CAPN15O75808 1086 aa22.25■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 GTF2A2P52657 109 aa22.25■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 TCP10Q12799 353 aa22.25■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 NFIAQ12857 509 aa22.25■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 DGKZQ13574 1117 aa22.25■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 ERO1BQ86YB8 467 aa22.25■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
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COMMD4-218ENST00000567377 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
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COMMD4-218ENST00000567377 TBC1D8O95759 1140 aa22.24■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 BTDP43251 543 aa22.24■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.24■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.24■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 GPR25O00155 361 aa22.23■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 GJA5P36382 358 aa22.23■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 RGS3P49796 1198 aa22.23■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 PI16Q6UXB8 463 aa22.23■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.23■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
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COMMD4-218ENST00000567377 LAMB1P07942 1786 aa22.22■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.22■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.22■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
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COMMD4-218ENST00000567377 AK9Q5TCS8 1911 aa22.21■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 RAB11FIP3O75154 756 aa22.21■■□□□ 1.15
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COMMD4-218ENST00000567377 BAG3O95817 575 aa22.21■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 PLCG2P16885 1265 aa22.21■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 PPATQ06203 517 aa22.21■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.21■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.21■■□□□ 1.15
COMMD4-218ENST00000567377 OTOFQ9HC10 1997 aa22.2■■□□□ 1.14
COMMD4-218ENST00000567377 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
COMMD4-218ENST00000567377 FKTNO75072 461 aa22.2■■□□□ 1.14
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