RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 TPM2P07951 284 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 GNALP38405 381 aa6.54□□□□□ -1.36
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CAPN3-211ENST00000562199 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 ODR4Q5SWX8 454 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 PDXDC1Q6P996 788 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.54□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 AGAP3Q96P47 875 aa6.54□□□□□ -1.36
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CAPN3-211ENST00000562199 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa6.54□□□□□ -1.36
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CAPN3-211ENST00000562199 ADCY10Q96PN6 1610 aa6.54□□□□□ -1.36
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CAPN3-211ENST00000562199 RBL2Q08999 1139 aa6.53□□□□□ -1.36
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CAPN3-211ENST00000562199 PGBD3Q8N328 593 aa6.53□□□□□ -1.36
CAPN3-211ENST00000562199 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
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CAPN3-211ENST00000562199 CFHR5Q9BXR6 569 aa6.52□□□□□ -1.37
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CAPN3-211ENST00000562199 USP47Q96K76 1375 aa6.52□□□□□ -1.37
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CAPN3-211ENST00000562199 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.51□□□□□ -1.37
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CAPN3-211ENST00000562199 TAF11Q15544 211 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.51□□□□□ -1.37
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CAPN3-211ENST00000562199 IWS1Q96ST2 819 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 IER2Q9BTL4 223 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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CAPN3-211ENST00000562199 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 PHF24Q9UPV7 400 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 GJA3Q9Y6H8 435 aa6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CAPN3-211ENST00000562199 CEP170Q5SW79 1584 aa6.5□□□□□ -1.37
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