RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-210ENST00000559586 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-210ENST00000559586 MRIQ9BWK5 157 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-210ENST00000559586 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-210ENST00000559586 LAMB1P07942 1786 aa24.72■■□□□ 1.55
RABGGTA-210ENST00000559586 ZBTB22O15209 634 aa24.71■■□□□ 1.55
RABGGTA-210ENST00000559586 OPTNQ96CV9 577 aa24.71■■□□□ 1.55
RABGGTA-210ENST00000559586 HOOK2Q96ED9 719 aa24.71■■□□□ 1.55
RABGGTA-210ENST00000559586 XAGE2Q96GT9 111 aa24.71■■□□□ 1.55
RABGGTA-210ENST00000559586 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
RABGGTA-210ENST00000559586 TCP10L2B9ZVM9 353 aa24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 GJA5P36382 358 aa24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 MAP3K9P80192 1104 aa24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 CRHR2Q13324 411 aa24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 ARHGEF6Q15052 776 aa24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC102BQ68D86 513 aa24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 TEKT1Q969V4 418 aa24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 TEPSINQ96N21 525 aa24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 ELP3Q9H9T3 547 aa24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 PCDH10Q9P2E7 1040 aa24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 CSADQ9Y600 493 aa24.7■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 MAST3O60307 1309 aa24.69■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 GTF2A2P52657 109 aa24.69■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 GPR108Q9NPR9 543 aa24.69■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.69■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 SP3Q02447 781 aa24.68■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.68■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 FKBP1CQ5VVH2 108 aa24.67■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 PTPN18Q99952 460 aa24.67■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM39BQ9GZU3 492 aa24.67■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 EFCC1Q9HA90 598 aa24.67■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.67■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 TNNI3KQ59H18 835 aa24.66■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM83AQ86UY5 434 aa24.66■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 MS4A4AQ96JQ5 239 aa24.66■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 ZDHHC15Q96MV8 337 aa24.66■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.66■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.66■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 RASGRF1Q13972 1273 aa24.65■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 VGLL4Q14135 290 aa24.65■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.65■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.65■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 SEMA3EO15041 775 aa24.64■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 CRBNQ96SW2 442 aa24.64■■□□□ 1.54
RABGGTA-210ENST00000559586 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 HMMRO75330 724 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 CCL15Q16663 113 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 HHIPL2Q6UWX4 724 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.63■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 DCAF15Q66K64 600 aa24.62■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.62■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 DENND2AQ9ULE3 1009 aa24.62■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.62■■□□□ 1.53
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RABGGTA-210ENST00000559586 SALL1Q9NSC2 1324 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 SPDYE5A6NIY4 337 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 CETPP11597 493 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 ERO1BQ86YB8 467 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 CDAN1Q8IWY9 1227 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 ARMC5Q96C12 935 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 GCC1Q96CN9 775 aa24.61■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 OTUD5Q96G74 571 aa24.61■■□□□ 1.53
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RABGGTA-210ENST00000559586 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 OTOFQ9HC10 1997 aa24.6■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 PRDX5P30044 214 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 PI16Q6UXB8 463 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 NBPF11Q86T75 865 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 WRNIP1Q96S55 665 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 HMG20BQ9P0W2 317 aa24.59■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 HTTP42858 3142 aa24.58■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 CACNB3P54284 484 aa24.58■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 SNAPC2Q13487 334 aa24.58■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.58■■□□□ 1.53
RABGGTA-210ENST00000559586 MCAMP43121 646 aa24.57■■□□□ 1.52
RABGGTA-210ENST00000559586 KIF22Q14807 665 aa24.57■■□□□ 1.52
RABGGTA-210ENST00000559586 GORABQ5T7V8 394 aa24.57■■□□□ 1.52
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.57■■□□□ 1.52
RABGGTA-210ENST00000559586 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.57■■□□□ 1.52
RABGGTA-210ENST00000559586 PPIL2Q13356 520 aa24.56■■□□□ 1.52
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.56■■□□□ 1.52
RABGGTA-210ENST00000559586 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.56■■□□□ 1.52
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