RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 MYH1P12882 1939 aa22.95■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 MX1P20591 662 aa22.95■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 NF2P35240 595 aa22.95■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 BTDP43251 543 aa22.95■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 MAP3K12Q12852 859 aa22.95■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.95■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 CST9Q5W186 159 aa22.95■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 DLK2Q6UY11 383 aa22.95■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.95■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.94■■□□□ 1.26
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RABGGTA-208ENST00000558954 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.93■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.93■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 ERC2O15083 957 aa22.93■■□□□ 1.26
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RABGGTA-208ENST00000558954 RASA3Q14644 834 aa22.93■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.93■■□□□ 1.26
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RABGGTA-208ENST00000558954 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.92■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 HTRA3P83110 453 aa22.92■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 NUCB1Q02818 461 aa22.92■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.92■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM83AQ86UY5 434 aa22.92■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
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RABGGTA-208ENST00000558954 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.91■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.91■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.91■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.91■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.91■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 CEP350Q5VT06 3117 aa22.91■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 PLCG2P16885 1265 aa22.9■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 FKBP1BP68106 108 aa22.9■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.9■■□□□ 1.26
RABGGTA-208ENST00000558954 BAG3O95817 575 aa22.89■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 CYP7A1P22680 504 aa22.89■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.89■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 CERS3Q8IU89 383 aa22.89■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.89■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.89■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.89■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
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RABGGTA-208ENST00000558954 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.88■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.88■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.88■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 IDI2Q9BXS1 227 aa22.88■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
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RABGGTA-208ENST00000558954 PDE1AP54750 535 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 RHBDL3P58872 404 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 NFIAQ12857 509 aa22.87■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 TEPSINQ96N21 525 aa22.87■■□□□ 1.25
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RABGGTA-208ENST00000558954 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
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RABGGTA-208ENST00000558954 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 RGS3P49796 1198 aa22.86■■□□□ 1.25
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RABGGTA-208ENST00000558954 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM151AQ8WW52 585 aa22.86■■□□□ 1.25
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RABGGTA-208ENST00000558954 TCP10Q12799 353 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 TEX11Q8IYF3 940 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.85■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
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RABGGTA-208ENST00000558954 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 KLRG1Q96E93 195 aa22.83■■□□□ 1.25
RABGGTA-208ENST00000558954 DOCK1Q14185 1865 aa22.82■■□□□ 1.24
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