RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 RTP1P59025 263 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-225ENST00000551253 LHX8Q68G74 356 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-225ENST00000551253 PBX4Q9BYU1 374 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-225ENST00000551253 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-225ENST00000551253 POTEB3A0JP26 581 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-225ENST00000551253 CLRN2A0PK11 232 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-225ENST00000551253 CYP2C8P10632 490 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-225ENST00000551253 PBX2P40425 430 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-225ENST00000551253 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-225ENST00000551253 EPHB4P54760 987 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-225ENST00000551253 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-225ENST00000551253 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-225ENST00000551253 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-225ENST00000551253 POTEBQ6S5H4 581 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-225ENST00000551253 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-225ENST00000551253 MICALL1Q8N3F8 863 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-225ENST00000551253 FBXW7Q969H0 707 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-225ENST00000551253 VEZTQ9HBM0 779 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-225ENST00000551253 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-225ENST00000551253 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-225ENST00000551253 DOCK3Q8IZD9 2030 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-225ENST00000551253 SH3TC1Q8TE82 1336 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 COL4A1P02462 1669 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 HMOX1P09601 288 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 PPATQ06203 517 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 TCF15Q12870 199 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 DNAH12Q6ZR08 3092 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 REV3LO60673 3130 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 DCXO43602 365 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 MOGSQ13724 837 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 TTLL5Q6EMB2 1281 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 HLA-CQ95604 372 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 TEPSINQ96N21 525 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 ATRNL1Q5VV63 1379 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 ECM29Q5VYK3 1845 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 FASNP49327 2511 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 TRIM43BA6NCK2 446 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 SPDYE2BA6NHP3 402 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 SPDYE6P0CI01 402 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 TNFAIP1Q13829 316 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 IER5LQ5T953 404 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 NLRP10Q86W26 655 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 FAM178BQ8IXR5 827 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 GJD2Q9UKL4 321 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 MYL6BP14649 208 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 ATP2B4P23634 1241 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 ST3GAL2Q16842 350 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 TRIB2Q92519 343 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 PDLIM7Q9NR12 457 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 FAM86C1Q9NVL1 165 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 MSRAQ9UJ68 235 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 ACACBO00763 2458 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 GRXCR1A8MXD5 290 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 PROB1E7EW31 1015 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 CFAP100Q494V2 611 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 GPAT2Q6NUI2 795 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 CDAN1Q8IWY9 1227 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 COA1Q9GZY4 146 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 TRPC6Q9Y210 931 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 GPR179Q6PRD1 2367 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 CHD9Q3L8U1 2897 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 XDHP47989 1333 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 RAB30Q15771 203 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 ASCL5Q7RTU5 278 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 GAS2L2Q8NHY3 880 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 WRNIP1Q96S55 665 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 MTCH2Q9Y6C9 303 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 FAM186AA6NE01 2351 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 NCOR2Q9Y618 2525 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-225ENST00000551253 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 MED23Q9ULK4 1368 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 FPGSQ05932 587 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-225ENST00000551253 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms