RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549355.1

PTPRQ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRQ, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-204ENST00000549355 A6NJR5 290 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 SLC24A1O60721 1099 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 MED14OSP0DP75 135 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 NEUROD2Q15784 382 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 AOC3Q16853 763 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 PARD6AQ9NPB6 346 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 PLAGL2Q9UPG8 496 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 ARAP1Q96P48 1450 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 CHD1O14646 1710 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 GLI1P08151 1106 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 IKBKEQ14164 716 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRQ-204ENST00000549355 POM121CA8CG34 1229 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 CTSBP07858 339 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 CNTN3Q9P232 1028 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 ADAMTS12P58397 1594 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 MCM6Q14566 821 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 MKNK2Q9HBH9 465 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 PBRM1Q86U86 1689 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 OXCT1P55809 520 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 CIAPIN1Q6FI81 312 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 NXPE3Q969Y0 559 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 TNFRSF10BO14763 440 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 ATG14Q6ZNE5 492 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 BSNDQ8WZ55 320 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 ARXQ96QS3 562 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 KCNK12Q9HB15 430 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 DYMQ7RTS9 669 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 ADAMTS20P59510 1910 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 CUL7Q14999 1698 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 SYN1P17600 705 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM87AP0C7U9 286 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 AFMP43652 599 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 BCANQ96GW7 911 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 ELP3Q9H9T3 547 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 LGR6Q9HBX8 967 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 CEP170Q5SW79 1584 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 CEACAM5P06731 702 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 ASPAP45381 313 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 MPZL3Q6UWV2 235 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM13BQ9NYF5 915 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 SHROOM2Q13796 1616 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM253P0C7T8 217 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 GLDCP23378 1020 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 LINC00310P59036 64 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 CDK5R2Q13319 367 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 C1orf127Q8N9H9 656 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 KCNC2Q96PR1 638 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 ZAP70P43403 619 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 GSTM4Q03013 218 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 KIRREL1Q96J84 757 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 TNIKQ9UKE5 1360 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 PTPRGP23470 1445 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 EEA1Q15075 1411 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 USP17L15C9J2P7 530 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 USP17L10C9JJH3 530 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 USP17L13C9JLJ4 530 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 USP17L12C9JPN9 530 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 USP17L11C9JVI0 530 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 USP17L21D6R901 530 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 USP17L18D6R9N7 530 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 USP17L22D6RA61 530 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 USP17L19D6RCP7 530 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 USP17L20D6RJB6 530 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRQ-204ENST00000549355 USP17L24Q0WX57 530 aa7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms