RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549306.1

HECTD4-210, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HECTD4, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
HECTD4-210ENST00000549306 WDR18Q9BV38 432 aa9.05□□□□□ -0.96
HECTD4-210ENST00000549306 EHD4Q9H223 541 aa9.05□□□□□ -0.96
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF576Q9H609 170 aa9.05□□□□□ -0.96
HECTD4-210ENST00000549306 AP3B2Q13367 1082 aa9.04□□□□□ -0.96
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
HECTD4-210ENST00000549306 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa9.04□□□□□ -0.96
HECTD4-210ENST00000549306 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
HECTD4-210ENST00000549306 ITPKAP23677 461 aa9.03□□□□□ -0.96
HECTD4-210ENST00000549306 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9.03□□□□□ -0.96
HECTD4-210ENST00000549306 WFDC3Q8IUB2 231 aa9.03□□□□□ -0.96
HECTD4-210ENST00000549306 NETO1Q8TDF5 533 aa9.03□□□□□ -0.96
HECTD4-210ENST00000549306 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.03□□□□□ -0.96
HECTD4-210ENST00000549306 ARID3CA6NKF2 412 aa9.02□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 FAM87AP0C7U9 286 aa9.02□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 PIDD1Q9HB75 910 aa9.02□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa9.02□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 SLFN14P0C7P3 912 aa9.01□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 FUT4P22083 530 aa9.01□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 CDK5R2Q13319 367 aa9.01□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 TMPRSS2O15393 492 aa9□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 CD8BP10966 210 aa9□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 LIG1P18858 919 aa9□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 FAM181AQ8N9Y4 354 aa9□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 ATXN3LQ9H3M9 355 aa9□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 CRIM1Q9NZV1 1036 aa9□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 VAV3Q9UKW4 847 aa9□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF124Q15973 351 aa8.99□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 DBX1A6NMT0 343 aa8.98□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 ID3Q02535 119 aa8.98□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 PRKCQQ04759 706 aa8.98□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.98□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 PI4K2BQ8TCG2 481 aa8.98□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 FAM168AQ92567 244 aa8.98□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.98□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 NPHS2Q9NP85 383 aa8.98□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 ICMTO60725 284 aa8.97□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 PKN1Q16512 942 aa8.97□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa8.97□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.97□□□□□ -0.97
HECTD4-210ENST00000549306 CARNS1A5YM72 827 aa8.96□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 PDE3BQ13370 1112 aa8.96□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 ORC1Q13415 861 aa8.96□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.96□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 DISC1Q9NRI5 854 aa8.96□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.95□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 NDUFB5O43674 189 aa8.95□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 AOC3Q16853 763 aa8.95□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 KSR1Q8IVT5 923 aa8.95□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 MKNK2Q9HBH9 465 aa8.95□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 ABCB6Q9NP58 842 aa8.95□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa8.95□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF862O60290 1169 aa8.94□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 CD96P40200 585 aa8.94□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.94□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.94□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 HRASLS5Q96KN8 279 aa8.94□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.94□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 TMEM265A0A087WTH1 108 aa8.93□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 H3BRB1 525 aa8.93□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 TTLL4Q14679 1199 aa8.93□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa8.93□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8.93□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.93□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 KRT82Q9NSB4 513 aa8.93□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.93□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 LEFTY1O75610 366 aa8.92□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 FAAP100Q0VG06 881 aa8.92□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 SLC38A3Q99624 504 aa8.92□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.92□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.92□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 U3KQE9 123 aa8.92□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 CEACAM5P06731 702 aa8.91□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 OXCT1P55809 520 aa8.91□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 ECM1Q16610 540 aa8.91□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.91□□□□□ -0.98
HECTD4-210ENST00000549306 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms