RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 DEFB129Q9H1M3 183 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 BOLA2Q9H3K6 86 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 LRP2BPQ9P2M1 347 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 FZD1Q9UP38 647 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 PHIPQ8WWQ0 1821 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 GOLIM4O00461 696 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 IDH1O75874 414 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 ATP5JP18859 108 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 BTDP43251 543 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 NFIAQ12857 509 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 RASA3Q14644 834 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 MOB2Q70IA6 237 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 ADGRA1Q86SQ6 560 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 GCC1Q96CN9 775 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 TMEM39BQ9GZU3 492 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 TLL2Q9Y6L7 1015 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 SALL3Q9BXA9 1300 aa10.51□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 PTPRFP10586 1907 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 CHGBP05060 677 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 PRKG1Q13976 671 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 SMC5Q8IY18 1101 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 LNPKQ9C0E8 428 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 ECHDC1Q9NTX5 307 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 TMOD2Q9NZR1 351 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 RASSF10A6NK89 507 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 RHBDL3P58872 404 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 TCP10Q12799 353 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 TNFAIP1Q13829 316 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 SLFNL1Q499Z3 407 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 SAPCD2Q86UD0 394 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 MAGEB6Q8N7X4 407 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 PI4K2BQ8TCG2 481 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 KLRG1Q96E93 195 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 TEPSINQ96N21 525 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 HAUS7Q99871 368 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 USP40Q9NVE5 1235 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 PAG1Q9NWQ8 432 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP10.49□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 FAM198AQ9UFP1 575 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 MX1P20591 662 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 CYP7A1P22680 504 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 TNNI2P48788 182 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 HUNKP57058 714 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 GSTO1P78417 241 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 GRM1Q13255 1194 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 PICALMQ13492 652 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 CYP4F22Q6NT55 531 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 ZFPM1Q8IX07 1006 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 SLF2Q8IX21 1173 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 C2orf69Q8N8R5 385 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 MIGA1Q8NAN2 632 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 GPATCH3Q96I76 525 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 LDHCP07864 332 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 PDE6AP16499 860 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 NF2P35240 595 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 VEGFBP49765 207 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 RGS3P49796 1198 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 MAP3K12Q12852 859 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 DEFB115Q30KQ5 88 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 FAM83AQ86UY5 434 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 TTC41PQ6P2S7 1318 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 UBE2Q2LH0YL09 131 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 SLURP2P0DP57 97 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 NUCB1Q02818 461 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 FKBP1CQ5VVH2 108 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 CHD1LQ86WJ1 897 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 TEX11Q8IYF3 940 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 FAM151AQ8WW52 585 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 IDI2Q9BXS1 227 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 ZNF532Q9HCE3 1301 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-211ENST00000548041 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 ATRNL1Q5VV63 1379 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
CS-211ENST00000548041 AOC2O75106 756 aa10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms