RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546585.1

CS-203, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,803 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-203ENST00000546585 PSME4Q14997 1843 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 GRIK5Q16478 980 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 CDC37L1Q7L3B6 337 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 CTNNA3Q9UI47 895 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 SMC3Q9UQE7 1217 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 XDHP47989 1333 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 GPSM2P81274 684 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 EVX2Q03828 476 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 MASTLQ96GX5 879 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 PODXL2Q9NZ53 605 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 SCN9AQ15858 1988 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 NID2Q14112 1375 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 FGRP09769 529 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 PRDX5P30044 214 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 STK3Q13188 491 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 SP8Q8IXZ3 490 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 ANAPC4Q9UJX5 808 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 NAV1Q8NEY1 1877 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 H0YIN7 160 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 ZNF213O14771 459 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 PRC1O43663 620 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 MECOMQ03112 1051 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 CAVIN4Q5BKX8 364 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 STYK1Q6J9G0 422 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 MIGA1Q8NAN2 632 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 NCOA7Q8NI08 942 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 STAG1Q8WVM7 1258 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 AIDAQ96BJ3 306 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 GDPD2Q9HCC8 539 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 POLLQ9UGP5 575 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 CYP7A1P22680 504 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 ATP2B4P23634 1241 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 MCM5P33992 734 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 RESTQ13127 1097 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 SDR42E1Q8WUS8 393 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 MTFR1LQ9H019 292 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 LY9Q9HBG7 655 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 CNPY2Q9Y2B0 182 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 MYH6P13533 1939 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 B4E1Z4 1266 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 IL1R1P14778 569 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 GNAT2P19087 354 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 PTMSP20962 102 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 NTRK3Q16288 839 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 FAM173BQ6P4H8 233 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 USP48Q86UV5 1035 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 C2CD5Q86YS7 1000 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 ZSWIM5Q9P217 1185 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 LRP2BPQ9P2M1 347 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 ABCF2Q9UG63 623 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 MYH1P12882 1939 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 PTPDC1A2A3K4 754 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 IGSF3O75054 1194 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 ZNF445P59923 1031 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 CCT2P78371 535 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 SEC23AQ15436 765 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 AKNAD1Q5T1N1 836 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 TTC6Q86TZ1 520 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 TBC1D16Q8TBP0 767 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 CNKSR1Q969H4 720 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 GGA1Q9UJY5 639 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP8.15□□□□□ -1.1
CS-203ENST00000546585 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms