RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545436.5

LMO3-232, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 530 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-232ENST00000545436 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
LMO3-232ENST00000545436 RAD17O75943 681 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-232ENST00000545436 USP17L8P0C7I0 530 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-232ENST00000545436 ZNF384Q8TF68 577 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-232ENST00000545436 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.85□□□□□ -0.03
LMO3-232ENST00000545436 M0R2C6 588 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-232ENST00000545436 MBD4O95243 580 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-232ENST00000545436 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
LMO3-232ENST00000545436 CRKP46108 304 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-232ENST00000545436 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
LMO3-232ENST00000545436 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-232ENST00000545436 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-232ENST00000545436 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
LMO3-232ENST00000545436 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-232ENST00000545436 RNF181Q9P0P0 153 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-232ENST00000545436 JAG2Q9Y219 1238 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-232ENST00000545436 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-232ENST00000545436 LAMA4Q16363 1823 aa14.84□□□□□ -0.03
LMO3-232ENST00000545436 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
LMO3-232ENST00000545436 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 PRELPP51888 382 aa14.83□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 KRT32Q14532 448 aa14.83□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.83□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.83□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.83□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 C22orf23Q9BZE7 217 aa14.83□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.83□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 MYO1BO43795 1136 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 HSPA4P34932 840 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 BTDP43251 543 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 C9orf131Q5VYM1 1079 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 ADGRA1Q86SQ6 560 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 KCNB2Q92953 911 aa14.82□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 SCN4AP35499 1836 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 H7C1D1 291 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 KCNA4P22459 653 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 NECTIN1Q15223 517 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 DLGAP5Q15398 846 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 GRIK5Q16478 980 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 LCORLQ8N3X6 602 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 IDI2Q9BXS1 227 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 NAPBQ9H115 298 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 ARMT1Q9H993 441 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa14.81□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 NAV1Q8NEY1 1877 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 SEC24BO95487 1268 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 SPDYE6P0CI01 402 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 RHBDL3P58872 404 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 SBK1Q52WX2 424 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 IL25Q9H293 177 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 LAMB1P07942 1786 aa14.8□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 F8W031 263 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 FGAP02671 866 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 APPP05067 770 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 TNFAIP1Q13829 316 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 CFAP100Q494V2 611 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 TEX11Q8IYF3 940 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.79□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.78□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 ENTPD3O75355 529 aa14.78□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 CHGBP05060 677 aa14.78□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 PSMA5P28066 241 aa14.78□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 USP5P45974 858 aa14.78□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 TDO2P48775 406 aa14.78□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 PTH1RQ03431 593 aa14.78□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 FAM83AQ86UY5 434 aa14.78□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 MXD3Q9BW11 206 aa14.78□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
LMO3-232ENST00000545436 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.9 ms